Bab 2 Klasifikasi Dan Taksonomi Kuman

tr KLASI FIKASI DANTAKSON OMI KUMAN Aidiffiet ChatimUntuk klasifikasi dan determinasi kuman dipa- - Kingdom : Procaryotae - Divisio : Cyanobacteriakai buku Bergqt's Manual of Determinatiae - Divisio II: BacteriaBacteriologlt yang menggambarkan sifat-sifat Bakteria dibagi dalam tiga kelas dan pem-kuman secara terperinci. bagian selanjutnya adalah Bakteri' dan bakteri hijau diklasifikasikan - Ordo yang berakhiran - alessebagai tanaman primitif karena: - Familia yang berakhiran - ace e - Tribus yang berakhiran - eiae- mempunyai dinding sel seperti tanaman- beberapa jenis bakteri dan semua bakteri hijau - Genus - Spesies bersifat fotosintetik Contoh : Actinomycetales Dalam BergE bakteri dan bakteri hijau dima- Ordo Mycobacteriaceaesukkan dalam satu golongan tersendiri yang di- Mycobacteriumsebut proca ry otae (prokariota). Prokariota mem- Familia fuIy c o bacteriu m t ub erc ul o s ispunyai inti primitif dan berkembang biak secara Genusamitosis menjadi dua bagian. Inti terdiri dari SpesiesDNA yang terbuka dan tidak terbungkus dalam Nomenklatur (pemberian nama)suatu selaput atau membran. Eubacteria (bakteri Sepeni halnya t^naman, kuman juga mengguna-sejati) dan Archaebacteria ftakteri purba) kan dua nam4 yaitu nama binomial Binnnial name),termasuk procaryotae. Yang parogen terhadap yang diajukan oleh Linnaeus untuk ranamanmanusia, termasuk dalam Eubacteria. Sedangkan pada tahun 1753. Jadi nama kuman selalu ter-eukariota mempunyai inti yang sebenarnya dan diri dari nama genus dan epitbeton specifi.cum.mengalami mitosis. Nama genus dimulai dengan huruf besar dan epitheton specificum ditulis dengan huruf kecil. Prokariota bersel tunggal (uniseluler) danklasifikasiny a adalah sebagai berikut: 2t

22 Buku Ajar Mikrobiologi KedokteranMisalnya Staplrylococctts d'ureus. Nama genus Spesies adalah suatu jenis mikroorganisme yangsedapatnya memberikan keterangan mengenai sudah tertentu. Spesies bakteri ditentukan oleh:genus tersebut. t. Sifat-sifat struktural yang terdiri dari ben- Nama kuman dapat beras al dari kata baru tuk, besar, cara pergerakan, reaksi terhadap pewarnaan Gram sefta pertumbuhan ma-yang disesuaikan dalam bahasa latin atau nama kroskopik (sifat-sifat koloni).seseorang (penyelidik) yang dilatinkan' 2. Sifat-sifat biokimia dan kebutuhan akanContoh: nutrisi, produk-produk akhir metabolisme,Bacillus batang susunan biokimiavri komponen sel danClostridium spindle, pintalan yang metabolit-metabolitnya. halus 3. Sifat-sifat fisiologisnya terhadap oksigen,Micrococcus butir kecil temperatur, pH dan respons terhadap zat-z tErwinia dari nama Erwin antibakteri.Pasteurella dart nama Pasteur 4. Sifat ekologi.Salmonella dari nama Salmon 5. Komposisi basa DNA, homologi dan sifat-Salmonella typhi typhi merupakan sifat genetik. penyebab tifoid Strain adalah biakan murni kuman tersusun dari keiompok kuman yang merupakan keturunanSalmonella pullorwm ditemukan padaayam kuman dari satu isolat. Misalnya: Stapbylococcus aureus strain Oxford, merupakan kuman standarBrucella dari nama Bruce untuk macam-macam kepeduan di laboratorium.Brucella abortus : penyebab abortus pada Spesies bakteri men gandrng strain-strain (galur- ternak. galur) mikroorganisme yang sifat-sif.atny a secaraHemopbilws influenzae : pertama kali diasingkan garis besar sama tetapi memiliki perbedaan- dari penderita influenza perbedaan. Biovar ft iotip) merupakan s tr ain y ang dipilih sebagai strain y angterbaik untuk mewakili dan disangka sebagai pe- suatu spesies. \Taiaupun demikian strain-strain biovar (biotip) tidak dapat memperlihatkan semua nyebab influenza slfat strain-strain dalam suatu spesies, sehingga untuk menentukan bentuk-bentuk tertentu padaClostridium raelchii ditemukan oleh \7elch variasi strain digunakan penentuan subspesies seperti serotip (serovar), pathotip (pathovar),Nama-nama di atas adalah nama il miah (s c ient ifi' c mo,rphotip (morphovar), fagatip (phagovar).name). Sedangkan sehari-hari yang lebih banyakdipakai adalah:gonococcus-go Neisseria gonorrboeaesifilis Treponema pallidurn.Hansen Mycobacteriwm lepraeKoch, tbc fuIy c obacterium tub erculo s is Streptococcu s pn eu rnon iaePneumococcus

Klasifikasi dan Taksonomi Kuman 23Klasifikasi bakteri patogen 2 = jumlah sifat-sifat yangadapadakedua strain ! = jumlah sifat-sifat yang ada pada strain per-Berbeda dengan nomenklatur, tidak ada klasifi-kasi bakteri yang resmi. Bergey's Manual of Sys- tama saja.tematic Bacteriologlt edisi ke-8 tidak mengguna-kan lagi taksa yang lebih tinggi karena ketidak- 6 = jumlah sifat*ifat yang ada pada strain keduajelasan hubungan genetika. Bergey\ Manual yangterakhir membagi prokariota dalam empar sajadivisio utama: i = jumlah sifat-sifat yang tidak ada pada kedua I. Gracilicutes : bakteri negatif GramII. Firmicutes : bakteri positif Gram strainIII. Tenericutes : bakteri tanpa dinding sel Klasif ikasi berdasarkan genetikaIV. Archaeb acteria Perkembangan-perkembangan dalam biologi mo- lekuler memungkinkan diperolehnya informasiI, II dan III termasuk dalam Eubacteria. mengenai kekerabatan organisme-organismeTaksonomi numerik pada tingkat genetik berdasarkan:Menggambarkan persamaan, kemiripan dan per- - komposisi basa DNA - homologi sekuens DNA dan rRNA (RNAbedaan karakteristik bakteri. Jaccard similaritycoefficient (S1) menyatakan sifat-sifat yang positif ribosomal)saja. Sedangkan Simple matchingcofficient (S sttt) - pola-pola metabolisme stabil yang dikontrolmenyatakan sifat-sifat yang positif dan negatif. oleh genKoefisien-koefisien rersebur menggambarkan - polimer-polimer pada selpersentase sifat-sifat yang sama di ^nt^r^ - struktur organel dan pola regulasinya.organisme-organisme. Kekerabatan berdasarkan homologi asam nukleat (homologi sekuens DNA): ,ii 6 = guanin C = sitosin A = adenin T = timin