Webinar 3 Virus & Bioinformatics oleh Novi Aprilia Shania Putri

Virus & Bioinformatika Start! INBIOteens

Courtesy on Youtube : https://www.youtube.com/watch?v=Ok6IyTrzrLA

Go to www.menti.com and use the code 8310 7331

Courtesy on Youtube : https://youtu.be/sgYSxr4tIZg

1 Novi Aprilia Shania Putri 2 Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Brawijaya, Malang 082-332-696-668 [email protected] 3 4

Apa Saja yang Akan Dibahas dalam Webinar ini? 1. Virus? 2. Perananan Bioinformatika dalam Mempelajari Virus? 3. Demo

GEJALA KLINIS – PENYEBAB VIRUS Tomato spotted wilt virus (TSWV)





Struktur Virus 1 • Viral genome & Kapsid/Selubung 2 3 Kapsomer? 4 Genom : Materi Genetik Virus SS DNA DS DNA SS RNA DS RNA partikel virus berukuran kecil, sehingga ukuran genom virus kecil dan protein yang diproduksi sedikit









Peranan Bioinformatika dalam Mempelajari Virus M Bioinformatika Mengapa Bioinformatika T penting? X Bioinformatika, sesuai dengan asal katanya • Bagian dari kemajuan teknologi di abad 21 • Era pandemi = mobilisasi susah = tidak yaitu “bio” dan “informatika”, adalah menyurutkan minat dalam penelitian gabungan antara ilmu biologi dan ilmu teknik T informasi (TI). Basis data F

Kepentingannya apa bioinformatika dan virus? M T a Mengetahui informasi genetik X virus T F b Mengetahui transmisi zoonotik c Mengetahui replikasi virus d Trend epidemiologi dan resistensi obat serta perkembangan vaksin Salah satu cara untuk menangani penyakit viral adalah mengetahui mekanisme virus mengenali sel inang (manusia) Sehingga Dapat mendesign vaksin

4. Website you could open to study about virus M T : Fokus hari ini X T F

Basis Data Ibarat Seperti Salad M T Egg Pepper X T Tomato Cheese F

UniProt 1 2 3 4

UniProt-Influenza Virus-3 types M T 3D 2D TIPE A , B , C X T Neptune is the F fourth-largest planet in the Solar System TIPE A

UniProt-Protein Virus M T Neurominidase X Hemagglutinin T Matrix protein F

Display-Information M T Memilih organisme X T F

Information M Fungsi Status protein sudah banyak dilakukan T penelitian X T F

Situs Aktif dan Ikatan Kimia M T Fungsi Molekuler X Proses Biologis T F

Hospes virus Lokasi subseluler



Display UniProt M T Struktur protein X T F

Display UniProt M T Sequence X T Susunan F Asam Amino Struktur Protein

Protein Virus Influenza A virus (strain A/Wilson-Smith/1933 H1N1) (Influenza A virus(strain A/WS/1933 H1N1)) Neuraminidase P03470 (NRAM_I33A0) Protein Asam amino

Design Vaksin 1 2 1 Informasi sequence & 3 Optimasi struktur dan 3 struktur antigen virus imunologi antigen 4 2 Antigen engineering 4 Optimasi vaksin

HANDS-ON







“Punya semangat adalah satu 1 hal, konsistensi adalah hal 2 lain, bisa tetap bertahan 3 4 dengan segala kondisi itu baru ultimate skillset .” —Someone Famous

Resources ● Campbell, N. A., Urry, L. A., Cain, M. L., Wasserman, S. A., & Minorsky, P. V. (2017). Biology (Vol. 8). New York, NY, USA:: Pearson. ● Nandy, A., Manna, S., & Basak, S. C. (2020). Computational Methodology for Peptide Vaccine Design for Zika Virus: A Bioinformatics Approach. In Immunoinformatics (pp. 17-30). Humana, New York, NY.

TERIMAKASIH See ya on the next webinar, peeps…