4::ffiEes?Bhs€at Kaxmra KappEarr HVEe6er deatgam FrogtrasffB Sta€a nt-t O 34s'%r* o4 B':&' 5$':;rrtl*-',-fl-JI'jtrr$'-:..l T\"r.riuan Bab 3: '{*+o*EFgSetelah rnembaca Bab 3, dihanapkan pennbaea fflarnpu rnembuatgrafik Kapplan lYeier dengan rnenggunakan prograrn Stata sertarnarnpu rnelakukan intenpretasi survival rate\" median suryiyol danasumsi proporsional hazard.
Kinisaatnya kita mendiskusikan bagaimana kita membuat kurvaKapplan Meierl survival rote, median survivol, dan mengecek asumsiproporsional hazard dengan menggunakan Program Stata.A. Mempersiapkan data untuk analisis survival Untuk mempelajari bagaimana membuat Kurva KapplanMeier dengan menggunakan Stata, bukalah file survival-kanker.dta. Pada Stata terdapat langkah pendahuluan yang harus dilakukanjika akan mengolah data dengan stata. Langkah tersebut adalahmempersiapkan data untuk dapat diolah dengan cara analisissurvival. Cara mempersiapkan data untuk analisis survival adalahdengan perintah stset t, failure(foil) dengan t menunjukkan variabelperson time dan foil menuniukkan variabel status.Jadi,iika t digantimenladi time dan fail diganti meniadi status, maka perintah stset t,failure(fail) berubah meniadi stset time, failure(status). Sebelum sebelum data dipersiapkan untuk analisis survival,data pada stata adalah seperti gambar berikut.llPre*erve Fsstot* varg [8] -i f-\" *.\"\" ns st*tus time obat :tadi um1 1 ' lrl*n.i ngga 11 Sbet st.: Starli unr St*di unt ? Flen: nqga 3 ,3bat sta 5tad r tln Stadi urtt! 3 l,teni nEqa I *bat sta 5tq,J'i uxr4 4 Fleni ngqa 11 iSbat sta 5tacll unlJE 5 l,leni ngga 11 Crbat sta 5tadi um \tadr um6 6 l4eni ngqa 11 *bat sta Stail'i unr !tad'i unr / l{eni ngqa 4 *bat sta t} I Fleni nqg& 4 Obat sta 4 Ob*t sta $ lileni ngga 11 '*bat *ta10 ' 16 l,'!eni ngga Untuk memeprsiapkan data suPaya dapat dianalisis dengananalisis survival, lakukanlah langkah-langkah sebagai berikut. ::'.':'.': :'-\"?:\": :::' :'.^:'.Y.' :: Y:: :::
{ 'Klik stotistics ! Pilih survivol onalysis { Pilih set up & utilities ! Pilih declore data to be survival-time dotoAkan terlihat tampilan sebagai berikut.Msin il :l Weidrtc ,Odiffi Ad\"nc*dlme variaHe f] Mdtiple{eqd lD vdiade tF€ilure €ved Flfuia valesFsilda vaiabis 9-l:[f Oo rpl3hs4 d ietlir€ iddffihonff Cbd 8t catti'Ergnmm l.**CIK**l l*Eilcst-*\"l f-* ,sbmit*l { Pilih time pada kotak time varioble ! Pilih stotus pada kotak foilure varioble ! \" Ketik angka I pada kotak foilure voluesAkan terlihat tampilan sebagai berikut.Ildt I !. : \Jtrigl*r : 6ptim : ldvamd Ilircvairtla flMrnilosdlovainblaliD F.tk e *!si Failre vdrs: Fa&.lr vairblo: dd6vln Do iaa $s d $r*€ ihtdo$li8ilqc#*$uhgi HTDMProses sudah selesai. Klik Ok Membuat Kurva Kapllan Meier dengan Software Statistik
Akan terlihat tampilan sebagai berikut.. stset ti me , fai I u re (status=:1)obs . failure event: s(0ta,tutism=e=l 1 ti me i nterval :exi t on or before: fai I ure500 total obs. O excl usi ons500 obs. remaining, representing37O failures in single record/sing'le fai'lure data 472L total analysis time at risk, at risk from t: earlie'laststoobbseservreveddeenxtrity t: 0 t= 0 L2 Kemudian, lihatlah dato editor. Pada data editor, akan terlihattampilan sebagai berikut.lP*;]l-!eG;l Y.rl:[s] = J-* ttgtui tim obat stddim1 I Heninq{a. 11 obit ita StaCisx? ? mani nqgn l Obat rta Stddiunl I ffefri nq$a l olat sta 5ta,li un4 4 flrni nggd 11 obdt 'stata 5tadr!r ot'at5 5 I'lrni n'lqe 11 Stadi uni6 6 lrleni nqga 11 obat 5ta Stidi us Lleni n{q€ 4 obat 5ta ltadiM€ B Fleni ngga 4 obat 5ta 5tndi ua9 9 lt!enir,?ga obd std stadiffi10 LO Plenr nQ4a 11 4bat 5ta 5tadium Tampak sekarang telah ada variabel baru yang bernama -st,_d, _t, dan _to yang dinamakan sebagai variabel dummy. Denganmunculnya variabel dummy ini, maka data telah siap untuk dianalisisdengan analisis survival.Untuk selanjutnya, perintah mempersiapkan data untuk analisissurvival dapat dilakukan dengan mengetik kalimat perintah padabagian commond.Perintah umum : stset t, failure(fail)Contoh : stset time, failure(status) :Y:::::':n!!'.o:::!':::::'ly\"^:'.'Y:':::'::::':
B. Membuat kurva Kapplan Meier secara keseluruhan Untuk membuat kurva secara keseluruhan dengan menggunakanStata, lakukanlah langkah-langkah berikut Untuk membuat kurva Kapplan Meier secara keseluruhanlakukanlah langkah-langkah berikut. ,/ Klik stotistics ,/ Pilih survivol analysis ,/ Pilih summory stotistics, test, & tables ./ Pilih groph survivor and cumulative hozord function Akan terlihat tampilan sebagai berikut.\"', iqr,\" tatq:] t.1y;:qg-r:i:ej;i.i.qeai.4go\"1ri[ta;L\"ria+r:!rL+- l-s{rer\"...tr+ti: q;eti/D Grap! Kaila Fteie uvrfl lrd'd I-0 Unl! ued to 'epod rdtra Gr@ K6plffil4€ie f€il@ lm[on* Gralh Nel$on Aals cumulalive ha?dd functiont) Gr#h tmnothed hardd etiilaiei Jculat@il Se@de an dflsent geps al vecitied voi€Hes: lby varidbles];--- ----- .---.- liLil*A*-d**i-u-l*t*t'h*-e.'-*d-^-ir.-u-'i-**--b*z-er-o-!€luer ot adpsMt rdiBHes: . .-- -. , - .\"-*-*ili--^-: t-\"-.-i-F**n**r:*ij-ii\"*i!*:r''-;j:ii*i*.r!!,tl1r ii ii;jrj i.ii:lt: :ri:.:ii.,:j \"**\"-*-*:\"1 ***-.J: iri-i,r-r:qli!!i.:{r,4+r:,}36j Jlthowpoirtwiseesiidencebnrd$fft*ffi {- oF ..]f-cirF\"L.]i- r!,!lft- I ./ Pilih groph Kopplan Meier survivol function poda function ,/ Proses sudah selesai. Klik OkAkan terlihat tampilan sebagai berikut.. sts graph failure _d: status == | analysis time _c time MembuatKuntaKapllanr\"*r,O::r::Y:r:t:::r:.*3F
Kaplan-Meier survival estimate analysis timeSebagaimana dibahas pada Bab 2 melalui kurva Kapplan Meier,kita bisa mengetahui survivol time untuk waktu tertentu danmedion survivol, serta mengetahui apakah asumsi PH terpenuhiatau tidak. Untuk selanjutnya, perintah membuat kurva Kapplan Meier keseluruhan dapat dilakukan dengan mengetik kalimat perintah pada bagian commond. Perintah umum : sts graph ::':':Y'.',: ::.' :: :: :',: :.^::',y.' : : y:: ::'
C. Membuat kurva Kapplan Meier berdasarkan variabel bebasUntuk membuat kurva Kapplan Meier berdasarkan variabelbebas dengan menggunakan Stata, lakukanlah langkah-langkahberikut Klik stotistics Pilih survivol analysis ,/ Pilih summory stotistics, test, & tobles ./ Pilih groph survivor and cumulative hozard funaion ,/ ,/Akan terlihat tampilan sebagai berikut.iil;; tq-,:9.'iqi,:-rt*-eeu+\"t'{li!\"*lgs,\"Ftg:-+riSeojtru:- -t,ssed,igmq-i.eisi'it,-i ' & Ot*t' Xu**-ti\"i* svivor ldhm ri *--- 'l urls ea n qqrr* * Grqh K€da+ieier faise lelion $ G!@h Nehm+.ls Mddiw hadd turctim S Gr69h shdhrd hdrdd e$lin{elf gwde n d[tqd ffi d wdied vdirll6: {br ysiiltes}l]Adw nE diroh b:so rsher d.dqffit vdi.bles : -,--, -*: 'jj I :!i** r*is: +r :.!!:+ s* il she trituhe cs{ibEe bdds ':.tg{*g l,: -q\"\"(.--:\".*1*.1-=-€- ]f:_ff_i:Jl Pilih groph Kopplon Meier survivalfunaion podo funaion Masukan variabel obat pada kotak seporote on different groups of specified variable: (by varioble)il;.3r.r*.1 * Gr.ph Kado+ileier srivd hdih 11,9 iunr\ilsdieEpt.abs O Grah Kdds+nds ldtuE ndirft S Gr4fi NdsAilen cwilld* tEHd lsdim *cEdls.mMhdarddde H ssFda on dtlad $spr d selEd vaiabl$ ftry vs'i$hsli ilAdralllFqin*! gal \"4qg itiglll :Tq:: jil ,-_-_-__- ,-*-- _----*-_*-_r-___:J '.l :.!.rde i.i .rl1.r* +q!+: .l :t,*; .r:'i.+i:r LF;i!di :*.* --:j: fi sh* w\" o w* g\"do sb g*dv;s cdsdsE bdds =g{E l,::. st--{-q!!EE:Jffi,/ Proses sudah selesai. Klik Ok Membuat Kurva Kapllan Meier dengan Software Statistik
Akan terlihat tampilan sebagai berikut.. sts graph, by(obat) failure _d: status == | analysis time _c time Kaplan-Meier survival estimates, by obat analysis time obat = Obat baru obat = Obat standar Sebagaimana dibahas pada Bab 2, melalui kurva KapplanMeier, kita bisa mengetahui survivol tirne untuk waktu tertentudan medion survivol,serta mengetahui apakah asumsi PH terpenuhiatau tidak. 1 iUntuk selanjutnya, perintah membuat kurva Kapplan Meierberdasarkan variabel bebas tertentu dapat dilakukan denganmengetik kalimat perintah pada bagian command.Perintah u-u- : sts graph, by(variable)Contoh : sts graph, by(obat)::::: : ::':'I :::: : 3.\" :\": : : : : .^::'y, :' : : :'::
Membuat Kurva Kapllan Meier dengan Software Statistik
Search
Read the Text Version
- 1 - 10
Pages: