YTÜ Biten Projeler

INDEX BİYOTEKNOLOJİ / BIOTECHNOLOGY



İÇİNDEKİLER / INDEX Biyoteknoloji / Biotechnology • Manyetik Parçacık Görüntüleme (MPI) Tekniğine Dayalı Medikal Görüntüleme Cihazının Geliştirilmesi 1-2 Development of a Medical Imaging Device Based on Magnetic Particle Imaging (MPI) Technique • Dolaşımdaki Kanserli Hücrelerin (CTCs) Mekanik Sertlik (Cell Stifness) Yapısındaki Değişimini Ölçen Holografik Tek Hücre Görüntüleme Tekniği 3-4 Holographic Single Cell Imaging Technique for Measuring the Mechanical Cell Stiffness of Circulating Tumor Cells using the Quantitative Phase Imaging Method • Mekanik Dolaşım Destek Sistemi Geliştirilmesi 5-6 Development of Mechanical Circulatory Support System • Rejeneratif/Antibakteriyel Özellikli Kompozit Dolgu Malzemelerinin Geliştirilmesi ve Performansının Değerlendirilmesi Development of Regenerative/Antibacterial Composite Fillers and Evaluation of Their Performance 7-8 • Lale Taç Yapraklarından Pilot Ölçekli Doğal Boya Üretimi 9-10 Pilot-Scale Natural Dye Production From Tulip Petals Covid-19 Aşısında Kullanılmak Üzere Türkiye’nin Antijenik Peptid/Protein Kütüphanelerinin Oluşturulması, • Spesifik Antijenik Peptid/Proteinlerin Üretimi ve Aşı Formülasyonları Olarak İmmün Yanıt Sonuçlarının Eldesi Generation of a Local Library of Antigenic Peptides/Proteins to Use in Vaccine Development Studies 11-12 Against Covid-19, Production of Specific Antigenic Peptides/Proteins and Vaccine Formulations With Determined Immune Responses Ekmeklik Unların Pelemir (Cephalaria syriaca L.) ile Kuvvetlendirilmesi: Pelemir Tohumunun • Karakterizasyonu, Acılığın Giderilmesi ve Ekmekçilik Kalitesini Artırması Bakımından Değerlendirilmesi 13-14 Fortification of Wheat Flours With Cephalaria Syriaca: Characterization of Cephalaria Seeds, Removal of Its Bitterness and Evaluation of Its Effect On Increase of Bread Making Quality of Flours Tarımsal Atıklardan Elde Edilen Nano Gözenekli Silika Aerojellerin Gıda Katkı Maddesi Olarak • Değerlendirilmesi için Optimizasyon Çalışmalarının ve in Vitro Hücre Testlerinin Yapılması 15-16 Optimization Studies and in Vitro Cell Tests for the Evaluation of Nanoporous Silica Aerogels Obtained from Agricultural Wastes as Food Additives • Düşük Maliyetli ve Yüksek Verimli Mikrobiyal Yakıt Hücresi (MHY) Malzemeleri ile Atıksulardan Biyoelektrik Üretimi 17-18 Bioelectricity Production From Wastewater with Low Cost and Highly Efficient Microbial Fuel Cell (MFC) Materials • Mikroalg kültürünün sürdürülebilir enerji üretimi ve sera gazı mitigasyonunda kullanımı 19-20 The Use of Microalgae Culture in Sustainable Energy Production and Greenhouse Gas Mitigation Biyoreaktör Depo Sahalarında Nanomalzemelerin Davranışları ve Atıkların Ayrışma Prosesleri Üzerindeki 21-22 • Etkilerinin Araştırılması The Fate of Nanomaterials in Bioreactor Landfills and Their Effects on Solid Waste Degradation • Mikro-Robot Kolu Dizaynı, Üretimi ve Görsel Geri Besleme ile Temassız Manipülasyonu 23-24 Design/Implementation of a Micro-Robotic Arm and Non-Contact Manipulation with Visual Servoing  Nano-Yapılı Antimikrobiyal Kaplamaların Üç Boyutlu Filtreler Üzerine Elektrokinetik Biriktirme Yöntemi 25-26 • Kullanılarak Eldesi ve Karakterizasyonu Processing and Characterization of Antimicrobial Nano-Structured Coatings on 3-D Metallic Filters Using Electrophoretic Deposition • Membran Biyoreaktörlerde EPS’nin Membran Kirlenmesi Üzerine Etkisinin Reolojik Parametreler ile Belirlenmesi 27-28 Determination the Effect of EPS on Membrane Fouling with Rheological Parameters in Membrane Bioreactors • Osteo Entegrasyon ve Anti Mikrobiyal Özelliklerini Geliştirmek Üzere Titanyum Yüzeylerin Değiştirilmesi 29-30 Modification of Titanium Surfaces to improve Osteo Integration and Anti-Microbial Properties • Vankomisin ile Antibakteriyel Polimerlerin Konjugasyonu ile Sinerjistik Antibakteriyel Etkinliğinin İncelenmesi Conjugation of Vancomycin and Antibacterial Polymers to Investigate the Synergistic Antibacterial Activity 31-32

Anti-Kanser Ajanları ya da Gsk-3ß İnhibitörleri Olabilecek Heterohalkalı Yeni Moleküllerin Sentezi ve 33-34 • Aktivite Çalışmaları Synthesis and Activity Studies of New Heterocyclic Molecules Which Can be Anti-cancer Agents or Gsk-3ß Inhibitors • Gaz Bariyer Uygulamaları İçin Grafen Benzeri Bor Nitrür (BN)/Biyopolimer Nano Biyokompozitler 35-36 Graphene-Like BN/Biopolymers Nanobiocomposites for Gas Barrier Applications • Brusellozis’e Karşı Endemik Rekombinant Omp25 Proteinin Üretimi 37-38 Production of Endemic Omp25 Recombinant Protein Against Brucellosis • Fosfonyum Grupları İçeren Polielektrolitlerin Sentezi, Karakterizasyonu ve Antibakteriyel Etkinliklerinin İncelenmesi 39-40 Synthesis and Characterization of Phosphonium-Containing Polyelectrolytes and investigation of Their Antibacterial Activity • Diz Eklemi MR Görüntülerinde Kıkırdak Doku ve Menisküs Bölütleme ve Ölçümleme 41-42 Segmentation and Quantitative Assessment of Cartilage and Meniscus on Knee Joint MR images Ekşi Hamurdan Starter Kültür Olarak Kullanılabilecek Mayaların İzolasyonu, Teknolojik Özelliklerinin 43-44 • Belirlenmesi ve Bu Mayaların Ekmek Üretiminde Kullanılması Isolation of Yeasts That Can Be Used as Starter Culture From Sourdough, Determination of Technological Properties and Use of These Yeasts in Bread Production Mikroalgal Ekzopolisakkaritlerin Sütlü Tatlılar Endüstrisinde Kullanımı ve Biyoaktif, Reolojik ve Teknolojik • Özelliklerinin Belirlenmesi 45-46 Use of Microalgal Exopolysaccharides in Dairy Desserts Industry and Determination of Their Bioactive, Rheological and Technological Properties Pamuk Bitkisinden (Gossypium hirsutum) İzole Edilen NAD+-Bağımlı Format Dehidrogenaz’ın 47-48 • Rekombinant Üretimi ve Biyoteknolojik Kullanımının Araştırılması Investigation of Recombinant Production and Biotechnological Use of NAD+-dependent Formate Dehydrogenase isolated from Cotton Plant (Gossypium hirsutum) Theileriosis’in Tedavisinde Kullanılabilecek Yeni Bir İlaç Adayı Tespit Etmek İçin Kumarin Türevlerinin 49-50 • Theileria annulata’nın Enolaz Enzimini İnhibisyon Potansiyelinin Araştırılması Investigation on TheiIeria Annulata Enolase Inhibition Potential of Coumarin Derivatives to Identify New Drug Candidates to Be Used in The Treatment of Theileriosis Sıcaklığa Duyarlı Oligo (etilen glikol) Metil Eter Metakrilat (OEGMA) Temelli Polimerlerin Moleküler • Dinamik Yöntemi ile İncelenmesi 51-52 Investigation of Thermoresponsive Oligo (ethylene glycol) Methyl Ether Methacrylate (OEGMA) Based Polymers by Molecular Dynamics Method • Magnezyum Katkılı TiN Kaplamaların in Vivo Koşullarda Osteoentegrasyon Özelliklerinin Belirlenmesi 53-54 Assessment Osteointegration Properties of Magnesium Doped TiN Coatings in Vivo Conditions Dekstran ile Stabilize Edilmiş Üreaz Enzimi ve Kompozit Amonyum Sensör Kullanılarak Mikro Büyüklükte • Yeni Tip Potansiyometrik Üre Biyosensör Geliştirilmesi 55-56 Development of a Micro-Sized New Type of Potentiometric Urea Biosensor Using Dextran Stabilized Urease Enzyme and Composite Ammonium Sensor Pirinç Kabuğu Silikasından Yapay Kemik Olarak Kullanılabilecek Biyoaktif Camların Üretimi Ve Osteosit • Hücreleri Üzerine Etkisi 57-58 Production Of Bioactive Glasses For Artificial Bone Using Silica Obtained From Rice Husk Ash And It’s Effect On Osteocyte Cells • Farklı Nanopartiküllerin Yeşil Sentezi ve Bitkilere Etkileri 59-60 Green Synthesis of Different Nanoparticles and Its Effects on Plants İnsanlarda Akciğer Fonksiyon ve Mekaniğinin Müdahalesiz Ölçümü İçin Sistem Tasarımı ve Tıbbi Görüntü • Analizi ile Akciğer Yapısının İncelenmesi 61-62 A System Design for Non-Invasive Measurement of Lung Function and Mechanics and Examination of Lung Structure by Medical Image Analysis In Humans

Temiz Enerji Teknolojileri / Clean Energy Technologies • Hayvansal Atık Yönetimi 65-66 Animal Manure Management • Yenilenebilir Kaynakların Sürdürülebilir Kullanımı 67-68 Sustainable Utilization of Renewable Resources İETT Şehir İçi Otobüs Filosunun Yakıt Tüketimi ve Emisyon Yayımının Azaltılması Amacıyla Ölçüme Dayalı • Modellenmesi 69-70 Measurement Based Modelling of IETT Public Transport Bus Fleet for Decreasing the Fuel Consumption and Emissions • Farklı Atık Su Kaynakları Kullanarak Yeni ve Etkin Mikroalg Yetiştirme Sistemi Tasarımı ve Biyoyakıt Üretimi 71-72 New and Efficient Microalgae Cultivation System Design and Biofuel Production Using Different Wastewater Resources • Yüksek Enerji Yoğunluklu Asimetrik Süperkapasitör Üretimi 73-74 High Energy Density Asymmetric Supercapacitor Production Dayanıklı Konut ve Sürdürülebilirlik için Güçlendirme İşbirliği ve Yapı Bilgi Modellemesi: Sosyal İnovasyon • için Araştırma, Uygulama ve Destek 75-76 Building Information Modelling and Collaboration for Retrofit for Resilient Housing and Sustainability: Research, Practice and Support for Social Innovation Enjeksiyonlu Bir CNG Motorunda Kademeli Dolgu Oluşumu İçin Bölünmüş Yanma Odası Tasarımı ve 77-78 • Yanma Optimizasyonu Combustion Optimization and Divided Combustion Chamber Design for Stratified Charge Formation on an Injection Natural Gas Engine Yeni Geliştirilen Çapraz Akışlı Çoklu Tüp Mikrobiyal Yakıt Hücresi (Um2fc) ile Evsel Atıksu Akımından 79-80 • Elektrik Enerjisi Üretimi Electricity Generation from Domestic Wastewater Stream with Newly Developed Cross-Flow Multi- Tube Microbial Fuel Cell (Um2fc) • Oksijen İndirgenme Reaksiyonu İçin Düşük Maliyetli Ve Yeni Elektrokatalizör Sentezi 81-82 Synthesis of Low Cost and Novel Electrocatalysis for Oxygen Reduction Reaction Heteroaromatik Grup İçeren Oligotiyofen Türevlerinin Sentezi, Termal Ve Fotofiziksel Özelliklerinin 83-84 • İncelenmesi Synthesis and Investigation of Thermal and Photophysical Properties of Oligothiophene Derivatives Containing Heteroaromatic Groups Mikrobiyal Yakıt Hücresi İle Asit Oluşumu Ve Metan Oluşumu Safhasındaki Katı Atık Depolama Alanı 85-86 • Sızıntı Sularından Elektrik Üretimi Electricity Generation from Solid Waste Landfill Leachate at the Phase of Acid Formation and Methane Formation with Microbial Fuel Cell • Zeytin Karasuyundan Hidrojen ve Biyoyakıt Üretimi 87-88 Hydrogen and Biofuel Production from Olive mill wastewater Talep Cevabı Uygulamalarında Evsel İklimlendirme Cihazlarının Kullanımı İçin Hava Tahminlerine 89-90 • Dayanan Kullanıcı Konforu Odaklı Yeni Bir Yaklaşımın Geliştirilmesi Ve Uygulanması Development and Implementation of a Novel User-Comfort-Driven Approach Based on Weather Forecasts for Using Residential HVAC Units in Demand Response Applications Sodyum Bor Hidrürün Hidroliz Reaksiyonu İçin Etkin Co-Ti-B Üçlü Katalizörlerin Hazırlanması Ve Kinetik • Özelliklerinin İncelenmesi Preparation and Investigation of Kinetic Properties of Effective Co-Ti-B Triple Catalyst for Hydrolysis 91-92 Reaction of Sodium Borohydride Sıvı Kristal Malzemelerin Dizaynı, Sentezi, Mesomorfik Özelliklerinin İncelenmesi ve Organik Güneş 93-94 • Pillerine Uygulanması The Design, Synthesis, Investigation of Mesomorphic Properties of Liquid Crystal Materials and Application to Organic Solar Cells • Bor Mineral Atıklarının Fotovoltaik Uygulamalarda Kullanılması 95-96 Using in Photovoltaic Applications of Bor Mineral Wastes Güneş Pillerinde, Kontak Metallerinin Absorplayıcı CdTe’nin Yapısal Ve Elektro-Optik Aktivitelerine Etkisi • Üzerine: Yoğunluk Fonksiyonel Teori Çalışması On the Effects of Contact Metals on Structural and Electro-Optical Activities of CdTe the Absorber in 97-98 Solar Cells: A Density Functional Theory Study

Türkiye Rüzgar Enerjisi Potansiyelinin Pompa Depolamalı Hidroelektrik Santraller ile Elektrik Şebekesine • Entegrasyonu Integration of Turkey Wind Energy Potential to the Grid By Utilizing Pump Storage Power Plants 99-100 • Akıllı Evlerden Oluşan Mahalli Bir Bölgenin Talep Cevabı Stratejileri ile Koordineli İşletimi 101-102 Coordinated Operation of a Neighborhood of Smart Households under Demand Response Strategies Toprak ve Donatılı Bina Temeli Kaynaklı Isı Pompalarında Kaynak Isı Değiştiricisi Performansının 103-104 • İyileştirilmesi İçin Yeni Bir Uygulama Yönteminin Geliştirilmesi Development of a New Application Method for Improving Source Heat Exchanger Performance in Ground and Reinforced Building Foundation Source Heat Pumps Savunma Teknolojileri / Defence Technologies Yeni Nesil Euro6 Ağır Hizmet Motor Geliştirilmesi: Bölünmüş Püskürtme Stratejisi, Düşük Sıcaklıkta Yanma 107-108 • A new generation Euro6 Heavy Duty Diesel Engine Development: Multiple Injection Strategy – Low Temperature Combustion Hologram Araştırmaları ve Eğitimi Laboratuvarı 109-110 111-112 • Hologram Research and Education Laboratory Sürdürülebilir Kıyı Alanı İzleme Modeli için İHA ve İHA-LİDAR Verilerinde Otomatik Üç Boyutlu Kıyı Çizgisi Çıkartılması ve Analizi: Terkos (İstanbul) Örneği • Automatic 3D Shoreline Extraction and Analysis From UAV and UAV-LIDAR data for Sustainable Shoreline Monitoring: Case Study of Terkos (Istanbul) Otonom Arama Kurtarma Robotları için Keşif, Haritalama ve Kurban Tespit Algoritmalarının Geliştirilmesi 113-114 • Development of Exploration, Mapping and Victim Detection Algorithms for Autonomous Search and Rescue Robots • Kısa Menzilli Akıllı Alarm Sistemleri için Aktif ve Pasif Milimetrik Dalga Algılayıcı Tasarımı 115-116 Millimeter Wave Short Range Active and Passive Sensors for Intelligent Alarm Systems • Ku Band Rotary Joint Tasarımı ve Geliştirilmesi 117-118 Ku Band Rotary Joint Design and Fabrication Dijital Teknolojiler / Digital Technologies Rehabilitasyon Mühendisliğinde Yapay Zeka Teknolojilerinin Uygulanması: Mesleki Rehabilitasyon 121-122 • Danışmanları Eğitimi (INTECH) Implementation of Artificial Intelligent Technologies in Rehabilitation Engineering: Training for Vocational Rehabilitation Counsellors (INTECH) • Siber Güvenlik ve Biyometrik Araştırmalar Danışmanlık ve Test Merkezi 123-124 Cyber Security and Biometric Research Consultancy and Test Center • Havza Bilgi Sistemi Geliştirilmesi 125-126 Development of Watershed Information System • Bilimsel Araştırma ve Eğitimde Mobil Laboratuvar ile İleri Karakterizasyon Uygulamaları Advanced Characterization Applications with Mobile Laboratory in Scientific Research and Education 127-128 • Sibernetik Rehabilitasyon Destek Sistemi 129-130 Cybernetic Rehabilitation Aid Endüstriyel Robot Manipülatörlerinin Zaman Gecikmesi Altında Çıkış Geri Beslemeli Senkronizasyonu • Output Feedback Synchronization of Industrial Robot Manipulators Under Time Varying Communication Delays 131-132 • Kablosuz Algılayıcı Ağlarda Provenans ve Güven Bazlı Dinamik Ağ Yapılandırma Mimarisi Networks 133-134 Provenance and Trust Based Dynamic Network Configuration Architecture in Wireless Sensor • Bilgisayarla Görme Destekli Robot Sistemi için Nesnelerin Poz Tahmini 135-136 Pose Estimation of Objects for a Computer Vision Based Robotic System • Inverter Klima Akıllı Etkileşim Sistemi Tasarımı 137-138 Design of Inverter Air Conditioner Intelligent Interaction System

Temel Bilimler / Natural Sciences Girişimcilik Ekosistemindeki Aktörlerin Yaratıcı İşbirliğinin Geliştirilmesi ve Atölye Alt Yapısıyla Güçlendirilmesi • Developing Creative Cooperation of Actors in the Entrepreneurship Ecosystem and Strengthening 141-142 Through Workshop Infrastructure Ultraviyole Fotokimyasal Uçucu Bileşen Oluşturma-Atom Tuzak-Alevli Atomik Absorpsiyon 143-144 • Spektrofotometri Sistemi ile Pb, Cd, Ni, Co Elementlerinin Eser Seviyelerde Tayinleri Determination of Pb, Cd, Ni, Co at Trace Levels with Ultraviolet Photochemical Volatile Compound Generation-Atom Trap-Flame Atomic Absorption Spectrophotometry System Piridin Esaslı Yeni Mesogenik Malzemelerin Sentezi, Karakterizasyonu ve Elektro-Optik Özelliklerinin 145-146 • İncelenmesi The Synthesis, Characterization and Investigation of Electro-Optic Properties of Pyridine Based New Mesogenic Materials • Fosfor Grupları İçeren Polimerlerin Sentezi ve Alev Geciktirici Özelliklerinin Araştırılması 147-148 Synthesis of Phosphorus Containing Polymers and Investigating Their Flame Retardancy Properties • Teknolojik Uygulama Potansiyeline Sahip Kiral Yan Zincir Sıvı Kristal Polimerler 149-150 Chiral Side-Chain Liquid Crystal Polymers Having Technological Application Potential 151-152 • Karanlık Maddenin Aydınlık Yüzü: X-Işın Salınım Çizgilerinde Karanlık-Madde İzlerinin Araştırılıması 153-154 Bright Side of Dark Matter: Search for a Hint of Dark Matter From X-Ray Emission Lines Fotoaktif Hidrojellerin Misel Kopolimerizasyon ile Eldesi ve Floresans Madde Salım Davranışlarının • İncelenmesi Obtaining of Photoactive Hydrogels via Micellar Copolymerization and Investigation of Their Fluorescent Releasing Behaviours • Galaksi Kümeleri ile Karanlık Madde ve Evrenin Yapısal Analizi 155-156 The Study of Dark-Matter and The Structure of The Universe By Galaxy Clusters • Özel Tasarlanmış Morfolojiye Sahip Bor Nitrür Nano Yapılarını İçeren Yeni Polimer Kompozitlerinin Geliştirilmesi Development of New Polymer Composites Based on Boron Nitride Nanostructures with Particular 157-158 Designed Morphology • Kendiliğinden Yanmazlık Özelliğine Sahip Polimerlerin Sentezi, Karakterizasyonu ve Boya/Vernik 159-160 Formülasyonlarına Uygulanması Synthesis, Characterization and Application of Inflammable Polymers in Paint/Varnish Formulations • Süpermarketlerde Müşteri Sadakatini Etkileyen Faktörlerin Belirlenmesi 161-162 Determining The Factors Affecting Customer Loyalty In Supermarket Monotonik Homotopi ve Lie Semigrupları 163-164 • Monotonic Homotopy and Lie Semigroups Mühendislik Bilimleri / Engineering Sciences • Akdeniz Havzalarının Hidrolojisinde İklim Kaynaklı Değişiklikler - CLIMB 167-168 Climate Induced Changes on the Hydrology of Mediterranean Basins - CLIMB İnşaat Sektörü Mesleki Eğitim Modellerinde Anahtar Performans Göstergeleri için bir Avrupa Standardının • Belirlenmesi 169-170 Determination of a European Standard for Key Performance Indicators (KPIs) in Vocational Training Models of Construction Industry Sönümleyici Mesnet Test Merkezi 171-172 173-174 • Elastomeric Bearing Test Center 175-176 Arı Ürünleri Mükemmeliyet Merkezi (Araştırmacı Arılar) • Center of Excellence of Bee Products (Researcher Bees) • YTÜ-İSO Üniversite Sanayi İşbirliği ve Platform Projesi YTU-ISO University-Industry Cooperation and e Platform Project Yerli Bir Güç Transformatörleri İzleme Sistemi Geliştirilmesi ve Uygulaması 177-178 • Development and Implementation of an Online Monitoring System for Transformers

• Raylı Sistem Titreşimlerinin Çevreye Olan Etkilerinin Optimal Üstyapı Tasarımı İle Azaltılması 179-180 Reducing the Environmental Effects of Railway System Vibrations by Optimal Superstructure Design Paleotetis Aktif Kenarı Boyunca Triyas Yay Mağmatizmasının ve Kaynak Alan Değişiminin İzlenmesi: Tokat Masifi ve Yakın Pontid Bölgesinde Kumtaşlarındaki Detrital Zirkonların Bütünleşik U-Pb ve Lu-Hf İzotop Çalışması 181-182 • TraIing Triassic Arc Magmatism and Related Provenance Variation Related to the Palaeotethyan Active Margin: Combined U-Pb and Lu-Hf Isotopic Study of Detrital Zircons In Sandstones of the Tokat Massif and Adjacent Pontide Regions • Endüstriyel Otomasyon Eğitim, İnovasyon ve Teknoloji Geliştirme Merkezi Kurulması 183-184 Establishment of Industrial Automation Training, Innovation and Technology Development Center Tarihi Yapıların Tuğla Duvar Özgün Malzeme Özelliklerinin Belirlenmesi ve Yük Altında Davranışının Model • Deneylerle Araştırılması 185-186 Determination of the Original Material Properties of the Historical Monuments’ Brick Wall and Research of its Behaviour Under Loading with Model Experiments 23 Ekim 2011 (Mw=7.2) Van Depreminin Deprem Anı ve Sonrası Oluşan Kabuk Deformasyonlarının GPS • ve INSAR Yöntemleriyle Araştırılması 187-188 Investigation of Co-Seismic and Post-Seismic Crustal Deformations of the 23 October 2011 (Mw=7.2) Van Earthquake Using GPS and INSAR Techniques Yüksek Aydınlatma Verimli Beyaz LED Eldesi Amacıyla Kuantum Nokta ve Nadir Toprak Elementi İkili 189-190 Katkısının Tellürit Nanokompozit Camların Işıma ve Renk Özelliklerine Etkisinin İncelenmesi • Investigation of Quantum Dot and Rare Earth Element Co-Doping Effect on Luminescence and Color Properties of Tellurite Nanocomposite Glasses for High Luminous Efficiency White LEDs Geçiş Metal Oksit Katkılı Ağır Metal Oksit Camların Yapısal Değişimlerinin İletkenlik Özelliklerine Etkisinin 191-192 • İncelenmesi Investigation of the Effect of Structural Transformations on Electrical Conduction Properties of Transition Metal Oxide-Doped Heavy Metal Oxide Glasses Yüzeyi Fonksiyonlaştırılmış Karbon Nano-Tüplerle Takviyeli Alümina Ve Hidroksiapatit Esaslı Nano-Yapılı 193-194 • Seramiklerin Üretimi Ve Karakterizasyonu Processing and Characterisation of Surface Functionalized Carbon Nanotube Reinforced Nano-Structured Alumina and Hydroxyapatite Ceramics • Enjeksiyon Yöntemi (Grouting) İle Onarılmış Tarihi Tuğla Duvarların Yük Altında Davranışının İncelenmesi 195-196 Investigation of The Under Loading Behaviour of Traditional Brick Masonry Walls Consolidated with Grouting • Boy Kesme Hatlarında İşlenen Hassas Yüzeyli Metal Levhaları Otomatik Olarak İstifleme Makinası Geliştirme Development of Automatically Stacking Machine for Precision Surface Metal Sheets Processed in 197-198 Cut-to-Length Lines • Sıkışabilir Yatak Malzemesi Kullanımının Gömülü Esnek Boru Davranışına Etkilerinin Araştırılması 199-200 Investigating The Effect Of Using Compressible Bedding Material On The Behavior Of BurIed Flexible Pipes Doğrusal ve Doğrusal Olmayan Ayrık Zamanlı Çift-Modelli Sistemler İçin Kararlılık ve Kararlı Kılınabilme 201-202 Şartlarının Ortaya Konulması, Kontrolcü Tasarımı ve Uygulaması • Stability and Stabilization Conditions, Controller Design and Application for Linear and Nonlinear Discrete Time Bimodal Systems Kumtaşları İçin Tektonik Kaynak Alan Göstergesi U-Pb ve Lu-Hf İzotoplarını Kullanarak Permo-Triyas Yaşlı • Karakaya Kompleksi İçin Önerilen Alternatif Tektonik Modellerin Sınanması 203-204 Testing Alternative Tectonic Models of the Permo-Triassic Karakaya Complex Using U-Pb and Lu-Hf Isotopes of Detrital Zircons from Sandstones as Indicators of Tectonic Provenance • Metal Katkılı Yeni Bir Adsorban Üretimi, Karakterizasyonu ve Adsorpsiyon Performansının İncelenmesi 205-206 Production, Characterization, and Investigation of Adsorption Performance of a New Metal Additive Adsorbent • Fonksiyonel Bir Bileşen Olarak Gölevez (Colocasia Esculenta L. Schott) Ununun Fırıncılık Ürünlerinde Kullanımı The Use of Taro (Colocasia esculenta L. Schott) Flour in Bakery Products as a Functional Component 207-208 • Ticari Araç Direksiyon Sistemleri için Değişken Deplasmanlı Paletli Pompa Geliştirme 209-210 Variable Displacement Vane Pump Development for Commercial Vehicle Steering Systems Hibrit Elektrikli Araçlar İçin Daha Verimli Bir Motor Sürücü Devresi Tasarımı Ve Kontrolü 211-212 213-214 • Design And Control Of More Efficient Motor Drive Circuit for Hybrid/Electric Vehicles • Marmara Bölgesinde Düşey Yer Kabuğu Hareketlerinin Mutlak Gravite ve GPS Ölçüleri İle Araştırılması Investigation of Vertical Crustal Movements with Absolute Gravity and GPS Observations in Marmara Region

İçten Yanmalı Motorlarda Aşınma ve Sürtünmenin Azaltılması için Segmanların Yeni Geliştirilmiş Grafen • Kaplama Yöntemi ile İncelenmesi 215-216 Investigation of Piston Rings by New Developed Graphene Coating Method for Reducing Wear and Friction in Internal Combustion Engines Metal Kaplama Sanayi Atıksularının Elektrokoagülasyon ile Arıtımı, Su-Asit-Baz Geri Kazanımı ve Çamur 217-218 • Minimizasyonunun Sağlanması Treatment of Metal Coating Industrial Wastewaters by Wastewaters by Electrocoagulation, Water- Acid-Base Recovery and Providing Sludge Minimization • Binek araç koltuk Karkaslarının Yüksek Güçlü Uzaktan Fiber Lazer Kaynak Yöntemi ile Birleştirilmesi 219-220 Joining Passenger Car Seat Frames Using High Power Remote Fiber Laser Welding Method • Bloklu Rıhtım Yapılarının Sismik Davranışı ve Performans Parametrelerinin Belirlenmesi Seismic Response of the Block Type Quay Structures and Determination of Performance Parameters 221-222 • Soğutucularda Kondenser Performansının İyileştirilmesi 223-224 Improving the Condenser Performance of Refrigerators • Yapısal Sistemlerin Farklı Bozucu Girişler Etkisi Altındaki Titreşimlerinin Analizi ve Aktif-Pasif Kontrolü Vibration Analysis and Active-Passive Control of Structural Systems Against Various Disturbance Effects 225-226 Kompozit Sürtünmeli Fren Balatalarında Yerli Uçucu Kül Katkısının Balata Özelliklerine Etkisinin İncelenmesi • ve Kullanılabilirliğinin Saptanması 227-228 Investigating the Effect of Domestic Fly Ash on Lining Properties in Composite Friction Brake Lining and Determining Their Usability Yüksek Yoğunluklu Polietilenin ve Polipropilenin Antibakteriyel ve Mekanik Özelliklerinin Nano Boyutlu TiO2 • ve ZnO Tozlarının Katkısı ile Geliştirilmesi Improvement of Antibacterial and Mechanical Properties of High Density Polyethylene and 229-230 Polypropylene with the Addition of Nano Sized TiO2 and ZnO Particles Plastik Enjeksiyon Yöntemi ile Titreşim Sönümleyici Sandviç Yapılı Polimer/Metal Makro Kompozitlerin 231-232 • Üretilmesi ve Özelliklerinin Geliştirilmesi Production of Vibration Damping Sandwich Structured Polymer/Metal Macro Composites and Improvement ot Their Properties Değişik Geometrilerdeki Kondanser (yoğuşturucu) Boruları İçerisindeki Yoğuşmanın İncelenmesi ve 233-234 • Optimum Çalışma Şartlarının Belirlenmesi Examination of Condensation in Different Geometries of Condenser pipes and Determination of the Optimum Operational Conditions • Kıyı ve Deniz Yapılarının Parametrik Tasarımı (DESIMAR) 235-236 Parametric Design for Marine and Coastal Structures (DESIMAR) Doğrusal Katılaştırılmış Yüksek Mg İçeren Al-Mg Esaslı Çoklu Ötektik Alaşımların Mekanik, Elektriksel ve • Termal Özelliklerine Katılaşma Hızının Etkisinin İncelenmesi 237-238 Investigation of the Effect of Solidification Rate on the Mechanical, Electrical and Thermal Properties of Linear Solidified High Mg Containing Al-Mg Based Multiple Eutectic Alloys • Otomotiv Radar Uygulamaları İçin Çoklu Lens Anten Tasarımı 239-240 Multiple Lens Antenna Design form Automotive Radar Applications • Alüminyum Alaşımlarında İnklüzyonların Giderilmesi 241-242 Removal of Inclusions from Aluminum Alloys Fırçasız Doğru Akım Motorlarında Komütasyon Moment Dalgalanmasının İndirgenmesi İçin Doğrusal 243-244 • Olmayan Dayanıklı Kontrolcü Tasarımı ve Uygulaması Design and Implementation of a Nonlinear Robust Controller to Reduce the Commutation Torque Ripple of Brushless DC Motors Östenitik ve Martenzitik Paslanmaz Çeliklerin Nano Akışkan Kullanılarak MQL (Minimum Miktarda 245-246 • Yağlama) Yöntemi ile Sürdürülebilir Frezelenmesi Sustainable Milling of Austenitic and Martensitic Stainless Steels by MQL (Minimum Quantity Lubrication) Method Using Nanofluids • Sınıf 1 Alçak Tabanlı Araç Tasarımı için ECE-R-107 Regülasyonu Uyarınca Yolcu Hareketi Karakteristiğinin Belirlenmesi 247-248 Determination of In Vehicle Passenger Mobility Characteristics According to ECE-R-107 Regulation for Class 1 Low Floor Vehicle Design

Avrupa Birliği Direktifleri Perspektifiyle Havza/Alt-Havza Sınırlarının ve Kodlarının Belirlenmesine Yönelik Özgün Bir Metodolojinin Geliştirilmesi 249-250 • Developing an Original Methodology Intended for Determination of the River Basin/Sub-Basin Boundaries and Codes with Perspective of European Union Directives Ankara-Eskişehir Yüksek Hızlı Tren Hattında Hizmet Kalitesi ve Memnuniyetin Ölçülerek Etkili 251-252 Parametrelerin Araştırılması • Investigation of Factors Affecting Service Quality and Satisfaction in High Speed Rail System Between Ankara-Eskişehir Kinematik Deformasyon Analiz Modelinin Doğruluğunun Doğrusal Hareket Sistemleri Yardımıyla 253-254 • Araştırılması Investigation on the Accuracy of Kinematic Deformation Analysis Model with the Help of Linear Motion Systems Sosyal ve Beşeri Bilimler / Social Sciences and Humanities Kentsel Mültecilerin Adaptasyon ve Uyum Süreçlerine Yeni bir Bakış Açısı: Kapsayıcı Kent İnşası Amaçlı 257-258 • Sosyal İnovasyon Deneyi A New Perspective on the Processes of Adaptation and Integration of Urban Refugees: A Social Innovation Experiment Aimed at Building Inclusive Cities • Yıldız Sarayı Fotoğraf Koleksiyonu Üzerinden Osmanlı-İngiltere İlişkileri ve 19. Yüzyıl Amerikası British-Ottoman Relations Through Yildiz Palace Photography Collection and 19th Century America 259-260 Yıldız Sarayı Fotoğraf Koleksiyonu Osmanlı-Alman İlişkilerinde Yıldız Sarayı Fotoğraf Koleksiyonu Üzerinden • Karşılaşmalar/Tanışmalar/Kesişmeler (Sergi ve Kitap Projesi) Encounters / Acquaintances / Confrontations in Ottoman-German Relations Through Yildiz Palace 261-262 Photography Collection • Enerji Verimli Yaşam Biçimlerine Yönelik Toplumsal Veri-Döngüleri (CODALoop) 263-264 Community to Data Loops for Energy Efficient Lifestyles – CODALoop Kentsel Yaşam Laboratuvarı Deneyimlerinde Yenilikçi Kentsel Gelişme İçin Eylem Odaklı Planlama, Regülasyon • ve Yatırım İkilemleri (APRILab) 265-266 Action Oriented Planning, Regulation and Investment Dilemmas for Innovative Urban Development In Living Lab Experiences (APRILab) I. Dünya Savaşı’nı Yaşamak ve Hatırlamak: Hatırat ve Günlükleri Işığında Osmanlı Askerlerinin Çanakkale, • Kafkas, Irak ve Sina-Filistin Cepheleri Tecrübeleri Experiencing and Remembering the First World War: The Ottoman Soldiers’ Personal Experiences 267-268 on Çanakkale, Caucasus, Iraq and SinaI-Palestine Fronts in the Light of Their Memoirs and Diaries • Türkiye'de Dış Politika Krizlerinde Karar Verme ve Kriz Yönetimi Süreç Analizi 269-270 Analysis of Decision-Making and Crisis Management Process in Turkish Foreign Policy Sosyal Kaynaşma Bağlamında Kürt Meselesi 271-272 273-274 • Kurdish Issue Within the Context of Social Cohesion • İstanbul’daki Tarihsel Sayfiye Alanlarında Kentsel ve Mekansal Gelişim Süreci Urban and Spatial Development Process in the Historical “Sayfiye” Areas in Istanbul Kurumsal Sürdürülebilirlik Performansının Ölçülmesinde Alternatif Bir Model Önerisi: Türk Bankacılık • Sektörü Üzerine Bir Uygulama 275-276 An Alternative Approach for Corporate Sustainability Performance Measurement: An Application on Turkish Banking Sector Covid-19 Sürecinde Uzaktan Öğretme Süreci İle İlgili İlk ve Ortaöğretim Öğrencilerinin Algıları ve • Duygularına Yönelik Bir Analiz An Analysis on Perceptions and Emotions of Primary and Secondary School Students Related to the 277-278 Distance Teaching During CovId-19 Pandemic Process



Küresel rekabet düzeyinin her geçen gün artmasıyla birlikte rekabet stratejisinin temeli de giderek bilginin ve bu bilgi ile üretilmiş teknolojinin hareketliliğine doğru kaymıştır. Bu hareketlilikteki lokomotif güç ise, bilgi temelli üretimin ve fikrin sahibi olmanın parolası konumundaki İNOVASYON’dur. Bilgi ile yaratılan teknoloji, kendisini yaratan bilginin işlenmesi, saklanması ve iletilmesinde aktif rol oynadığından, bilgi ile teknoloji, hamuru inovasyon olan bir mobius bant gibidir. Bilgi teknolojileri tabanlı ekonomilere ulaşmanın hem ulusal hem de uluslararası rekabette önem kazandığı günümüz “DİJİTAL ÇAĞI”nda parametreler ve bunlara bağlı değişkenler dünyayı hızla etkilemektedir. Bu bağlamda bilgi tabanlı ekonomilere erişmede en büyük rol sahibi yeni nesil üniversite, değişime en hızlı biçimde ayak uyduran, araştırmacı, yeniliklere ve önceliklere hakim, girişimci, üretken, kamu-sanayi işbirliğine açık, PROAKTİF üniversite olarak tanımlanabilir. Teknolojik gelişmelerin, ekonomik ve sosyal hayatta dönüştürücü bir role sahip olması ile küresel düzeydeki rekabet artmış ve ülkeler kıyasıya bir yarış içerisine girmişlerdir. Bu yarışta ülkemizin, üst zincirde yer almasını sağlayacak yapıya sahip olması için Ar-Ge ve Eğitim odaklı bir altyapının üniversitelerce sağlanması gerekmektedir. Ülkemizin bölgesel kalkınmadaki liderliğini perçinleyecek, global kalkınma vizyonuna bağlı olarak “İstikrarlı ve güçlü ekonomi”, “Rekabetçi üretim ve verimlilik”, “Nitelikli insan, güçlü toplum”, “Yaşanabilir şehirler, sürdürülebilir çevre”, “Hukuk devleti, demokratikleşme ve iyi yönetişim” hedefleri doğrultusunda üniversitelerin üzerlerine düşen rol ve sorumluluğu “araştırma ve geliştirme, eğitim ve toplumsal sorumluluk faaliyetleri” ile yerine getirmesi önem arz etmektedir. İşte Yıldız Teknik Üniversitesi (YTÜ), kurulduğu günden bu yana gösterdiği gelişim ve sahip olduğu insan gücü ile ürettiği yenilikçilik esaslı projeleri ve sahip olduğu donanımı toplumla buluşturmakla yükümlü olduğunu bilmiştir. Bu bilinç ile de ülkemizin en nitelikli ve köklü kurumları arasında yer almaktadır. Kurum içi ve kurum dışı fonlar ile üniversitede üretilen ve rekabet gücünde önemli pay sahibi olan “BİLGİ”yi; teknoloji geliştirme bölgelerinde, kuluçka merkezlerinde “iş modellerine”; kamu ve sanayinin ihtiyacı doğrultusunda ticarileştirerek “ürüne” dönüştüren birçok proje yürütülmüş ve halen yürütülmektedir. İncelemiş olduğunuz bu kaynakta, YTÜ öğretim üyelerinin son 10 yılda başarı ile sonuçlanan projeleri yer almaktadır. TÜBİTAK başta olmak üzere, İSTKA, SANTEZ, TAGEM, TÜSEB ve Kültür ve Turizm Bakanlığı gibi ulusal kurumlar ve uluslararası kaynaklarla fonlanmış bu projeler; birçok ulusal ve uluslararası çıktı ile ülkemizin bilim ve teknoloji odaklı gelişimine katkı sağlamıştır. Biyoteknoloji, Temiz Enerji Teknolojileri, Savunma Teknolojileri ve Dijital Teknoloji alanlarında ön planda olan Üniversitemizde bu öncü alanların yanı sıra Temel Bilimler, Sosyal ve Beşeri Bilimler ile Mühendislik Bilimlerinde de YTÜ ve ülkemizin ARGE’sine, dolayısıyla bilim literatürüne katkı sağlayan projeler sizlerle paylaşılmıştır. YTÜ’nün ve ülkemizin gelişimine verdiğiniz katkılar için bu kaynakta adı bulunan öğretim üyelerimize teşekkürlerimi sunar, tüm akademisyenlerimizin YTÜ’yü ulusal alanda öncü, uluslararası sıralamalarda yer alan, ülke kalkınmasına ve milli hamlesine katkı sağlayarak, global ölçekte problemlerin çözümünde rol oynayan yenilikçi ve proaktif, yeni nesil dijital çağa uygun donanım ve yetkinliklere sahip bir üniversite haline dönüştürme hedeflerimize ulaşma yolundaki katkılarının devamını beklerim. Sevgi ve saygılarımla, Prof. Dr. Tamer YILMAZ Rektör

With global competition increasing day by day, the focus of competitive strategies has gradually shifted to the grounds of technology mobility created in an atmosphere of knowledge mobility. Innovation is the driving force behind this mobility and is the key to knowledge-based production and intellectual rights and property. Technology bears a close resemblance to the Möbius strip in that the very technology created through knowledge takes an active part in the processing, storing, and transferring of that knowledge. The parameters and variables entailed in the Digital Age are having impacts on a global scale and achieving the knowledge economy is of the utmost significance in the national and international competition settings. In this context, one of the biggest players in achieving the knowledge economy is the new generation universities. The new generation university can be defined as a proactive university equipped with the requisite skills in keeping up instantly with the latest developments and research, staying on top of innovation and priorities, being entrepreneurial and productive and open to public-industry collaboration. The countries of the world have undertaken a cut-throat competition once technological developments have started to have a transformative effect on the economic and social lives of the people, which in turn has resulted in a competition at a global scale. It is imperative that universities in Turkey establish and maintain an environment focused on research and development and high-quality education for our country to secure its position higher up on the competition in the food chain. It is also imperative that universities fulfill their parts and responsibilities in line with the objectives of the eleventh development plan, which are: a “Stable and strong economy”; YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY“competitive production and productivity”; “qualified people, strong society”; “livable cities, sustainable environment”; “rule of law, democratization, and good governance”; and fulfillment of those objectives with the activities devoted to research and development, education of the society, and social responsibility will ensure that Turkey will lead development in the region. Yildiz Technical University (YTU) has always been aware of its responsibilities of undertaking iitnsnroevsaetaivrcehprinofjreaTcsHttsruEdcetGvuerLeloOpaveBadAilwaLbitlUhe ifNtosrIcVtehEnetRuprSeyoI-TopYllde.ApArTongdTrHethsEiss, aiHtwsEsatrAreonRneTgssaOcmaFadkeems iYcTsUtanodniengo,f and the most qualified and rooted unAiveHrsIitSieTsOinRTIuCrkAeyL. HISTORY With its ability to draw internal and external funding, YTU has carried out and is currently involved in numerous projects by transferring “knowledge”, which is a product of the university and a key strength of competitive power, to “business models” in technology development zones and incubation centers, and to “products” by means of commercializing knowledge in line with the needs of the government and industry. The valuable resource you are currently BİYOTEKNOLOJİ / BIOTECHNOLOGYreading is comprised of the research projects successfully completed by YTU faculty members in the last 10 years. These projects are mainly funded by The Scientific and Technological Research Council of Turkey (TUBITAK) along with several national agencies such as the İstanbul Development Agency (ISTKA), the Ministry of Science, Industry, and Technology (SANTEZ), the General Directorate of Agricultural Research and Policies (TAGEM), the Presidency of Health Institutes of Turkey (TUSEB), and many other international funders. As a result, these projects have made valuable contributions to Turkey’s scientific and technological development over the years through ab infinite number of national and international outputs. In addition to the sophisticated projects in areas where YTU plays a prominent part, such as Biotechnology, Clean Energy Technologies, Defense Technologies, and Digital Technologies, the projects in areas such as Fundamental Research, the Social Sciences and Humanities and the Engineering Sciences, which also contribute to the research and development activities of YTU and Turkey, are also given in this valuable resource. I would like to take this opportunity to extend my sincerest thanks to the faculty members whose names have been honored in this resource for their contributions to the development of YTU and Turkey; and I have complete confidence in all YTU faculty members that they are going to contribute to our objectives of transforming YTU into a high-ranking global university, an innovative and proactive university becoming a solution partner for solving global problems, and a very well-equipped university with the competencies of the digital age. Faithfully Yours, Prof. Dr. Tamer YILMAZ Rector



YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY THE GLOBAL UNIVERSITY AT THE HEART OF HISTORY Biyoteknoloji / Biotechnology

01 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR BÖLÜM DOÇ. DR. / ASSOC. PROF. DR. AYHAN BİNGÖLBALİ DEPARTMENT BIYOMÜHENDISLIK / BIOENGINEERING BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI 01.10.2017 - 01.04.2021 START-END DATE TUBITAK 1003 DESTEK TÜRÜ 3.903.598 TL FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET MANYETİK PARÇACIK GÖRÜNTÜLEME (MPI) TEKNİĞİNE DAYALI MEDİKAL GÖRÜNTÜLEME CİHAZININ GELİŞTİRİLMESİ DEVELOPMENT OF A MEDICAL IMAGING DEVICE BASED ON MAGNETIC PARTICLE IMAGING (MPI) TECHNIQUE www.yildiz.edu.tr Manyetik parçacık görüntüleme (MPI) Magnetic particle imaging (MPI) is yeni bir medikal görüntüleme tekniği a new medical imaging technique olup, damar içine enjekte edilen manyetik performing a direct measurement nanoparçacıkların, Superparamagnetic of Superparamagnetic Iron Oxide Iron Oxide Nanoparticles-(SPION), Nanoparticles (SPION) injected into görüntülemede kullanılması esasına a body. MPI can acquire quantitative dayanmaktadır. Manyetik Rezonans images of the local distribution of Görüntüleme (MRI) tekniğinden the magnetic material yielding high farklı olarak MPI yönteminde görüntü spatial and temporal resolution. MPI hem uzaysal hem de zamansal olarak system is thought to have an important yüksek çözünürlüğe sahip manyetik role for medical applications such malzemenin bölgesel dağılımının as cell labeling and tracking in the kantitatif görüntülenmesiyle elde cardiovascular system and oncology edilir. MPI sisteminin kardiyovasküler (e.g., abnormal cells, engorged vessels). sistemde ve onkolojide hücre etiketleme In a conventional MPI method, the signal ve izleme (anormal hücreler, tıkanık strength is proportional to the quantity

01 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Doç. Dr. / Assoc. Prof. Dr. Ayhan BINGÖLBALI - TUBITAK 1003 damarlar vb.) gibi medikal uygulamalar için önemli of nanoparticles, thus the tracer concentration bir rol oynayacağı düşünülmektedir. MPI metodunda is measured directly at a certain location. MPI sinyal şiddeti nanoparçacıkların miktarına bağlıdır ve performs direct imaging of nanoparticles as tracers belirli bir bölgedeki nanoparçacık konsantrasyonu so that real-time imaging can be obtained via the ölçülür. Nanoparçacıkların izinin direkt olarak method. Additionally, there is no need for ionizing görüntülenebilmesi sebebiyle MPI yöntemi gerçek radiation in this technique. Due to these attractive zamanlı (real-time) görüntü elde etmek için de properties, there has been a growing interest in kullanılabilir. Ayrıca, MPI’da iyonize edici radyasyon magnetic particle imaging studies and the initial kullanılmamaktadır. Bu cazip özelliklerinden dolayı, outcomes are promising. MPI görüntülemesi üzerine çalışmalar yapılmaya Since MPI has more features than other imaging başlanmış olup, elde edilen sonuçlar oldukça ümit devices, it is thought that they could be used vericidir. efficiently in a clinical environment in near future. MPI cihazının diğer görüntüleme cihazlarından çok However, shortcomings here; in-vivo studies of daha üstün özelliklere sahip olmasından dolayı, yakın MPI are limited since the method is still under zamanda tıp alanında verimli bir şekilde kullanılacağı development. The reasons for that limited studies düşünülmektedir. Ancak buradaki eksiklikler are, for example, inability to obtain optimum size and MPI yeni ve hala geliştirilmekte olan bir teknoloji magnetic properties of SPIONs, narrow \"field-free olduğundan canlılar üzerindeki araştırmaları kısıtlı point\" (FFP) bore which provides the imaging, high olarak devam etmektedir. Bunun nedenleri arasında cost due to the use of shielding room. Furthermore, görüntülemede kullanılan SPION’ların boyutlarının software development for the automation of imaging ve manyetik özelliklerinin optimum olarak elde devices is required to convert complex signals to edilememesi, görüntülemenin sağlandığı manyetik simple data. The works be made on the project are alansız nokta,-“field free point” (FFP), hacminin çok planned to eliminate these shortcomings. küçük aralıkta olması, çalışılan frekans bölgesinin çok düşük olmasından dolayı iyi hassasiyet ve 1 çözünürlük elde edilememesi sayılabilir. Ayrıca, görüntüleme cihazlarının otomasyonu için karışık Normalde MPI (Magnetic Particle Imaging) MPI sinyallerini basit verilere dönüştürecek bilgisayar sisteminde uyarım alanı, sürücü alan ve alıcı yazılımının geliştirilmesi gerekmektedir. Projede bobinleri görüntü almak için yeterlidir. Fakat klinik yapılacak çalışmalarla bu eksikliklerin giderilmesi uygulamada hastanın sağlığı ve sürücü alanın planlanmaktadır. istenildiği gibi hareket ettirilememesi gibi bazı fizyolojik ve teknik sebeplerden dolayı ek manyetik alanlara ihtiyaç duyulmuştur. Bu ek alanlar odak alanı olarak isimlendirilmiştir. Uyarım alanını oluşturan bobinler, bu odak alanını oluşturan bobinlerle kombine edilebilmektedir. Şekil MPI tekniğinde kullanılan temel bobin sisteminin çizimi gösterilmektedir. Normally, in MPI (Magnetic Particle Imaging) system, the excitation field, driver field, and receive coils are sufficient to obtain images. However, in clinical practice, additional magnetic fields are needed due to some physiological and technical reasons such as the patient's health and the inability to move the driver field as desired. These additional areas are called focus areas. The coils forming the excitation field can be combined with the coils forming this focal area. Figure shows a basic coil system used in the MPI technique. MPI sisteminin temel şematik çizimi / MPI system Kaynak: 115E115& 776E777 no’lu TUBITAK projeleri kapsamında yapılan YL tezi (Furkan BALCI, YTÜ, 2020).

02 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR DR. ÖĞR. / ASST. PROF. DR. HÜSEYIN ÜVET BÖLÜM MEKATRONIK MÜHENDISLIĞI DEPARTMENT BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI MECHATRONICS ENGINEERING START-END DATE 15.12.2017 - 15.06.2021 DESTEK TÜRÜ TUBITAK 1003 FUNDED BY 2.459.993 TL BÜTÇESI BUDGET DOLAŞIMDAKİ KANSERLİ HÜCRELERİN (CTCs) MEKANİK SERTLİK (CELL STIFFNESS) YAPISINDAKİ DEĞİŞİMİNİ ÖLÇEN HOLOGRAFİK TEK HÜCRE GÖRÜNTÜLEME TEKNİĞİ HOLOGRAPHIC SINGLE CELL IMAGING TECHNIQUE FOR MEASURING THE MECHANICAL CELL STIFFNESS OF CIRCULATING TUMOR CELLS USING THE QUANTITATIVE PHASE IMAGING METHOD www.yildiz.edu.tr Günümüzde kanser odağının özelliklerinin In this project, our goal is to develop saptanmasında faydalanılan “Dolaşımdaki a new imaging system that allows us Kanser Hücreleri”nin (Circulating Tumor to measure the cancer cells' stiffness Cells - CTC) diğer kan bileşenlerinden and perform clinical tests. A so-called ayırt edilmesinde yararlanılan teknikler acoustic-holographic method is a new halen bir takım eksiklikler içermektedir. approach in the literature, and it will CTC’lerin normal kan bileşenlerine lead to further information and data boyut olarak benzemesi ve dolaşımdaki for cancer research. We hypothesize sayılarının göreceli azınlığı ayırt that our system will evaluate the phase edilmesini zorlaştırmaktadır. Kantitatif change of coherent light inducing the Faz Görüntüleme (Quantitative Phase CTCs under the acoustic pressure effect. Imaging) biyolojik örneklergibi, transparan Thus, CTCs will be distinguished from yapılarda başarı ile kullanılabilen bir other cells; moreover, this approach will tekniktir. Holografik bir yaklaşım olan image other responses under different bu teknik, mikro-nano seviyedeki conditions (different drug, temperature, parçacıkların görüntülenmesinde önemli pH, etc.) in the future. A comprehensive

02 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Dr. Öğr. Üyesi / Asst. Prof. Dr. Hüseyin ÜVET - TUBITAK 1003 bir yaklaşımdır. Literatürde, bu metodun hücrelerin consortium is composed of six universities, three 3 boyutlu morfolojik özelliklerinin çıkarılmasında research centers, and one start-up company. non-invaziv (tahribatsiz) bir teknik olarak kullanıldığı görülmektedir. Projemiz ile kanser hücrelerinin sertlik değerlerini saptamada yeni bir görüntüleme sisteminin geliştirilmesi ve klinik testlerinin yapılması hedeflenmektedir. Bu amaçla, 6 üniversite, 3 araştırma merkezi ve 1 özel şirketin bir araya gelmesi ile geniş bir konsorsiyum kurulmuştur. Mekatronik Müh, Elektronik Müh., Kimya Mühendisliği, Fizik Bölümü, Bilgisayar Müh., Tıbbi Biyokimya, Gastroenteroloji, Tıbbi Onkoloji, Epidemiyoloji Bölümlerini içeren disiplinler arası bir çalışmadır. 3

03 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ DOÇ. DR. / ASSOC. PROF. DR. ABDURRAHMAN KAMURAN KADIPAŞAOĞLU PRINCIPAL INVESTIGATOR BIYOMEDIKAL MÜHENDISLIĞI / BIOMEDICAL ENGINEERING 01.06.2019 – 01.08.2022 BÖLÜM TUBITAK 1003 DEPARTMENT 2.059.608 TL BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI START-END DATE DESTEK TÜRÜ FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET MEKANİK DOLAŞIM DESTEK SİSTEMİ GELİŞTİRİLMESİ DEVELOPMENT OF MECHANICAL CIRCULATORY SUPPORT SYSTEM www.yildiz.edu.tr Son evre Kronik Kalp Yetmezliği (KKY) Heart transplantation is the only non- için palyatif olmayan tek tedavi kalp palliative treatment for end-stage transplantasyonudur; fakat donör organ Chronic Heart Failure (CHF); however, sayısının nakil bekleyen hasta sayısına the insufficient number of donor oranla yetersiz olması girişimin etkinliğini organs compared to the number of kısıtlamaktadır. Bu hasta grubu için patients awaiting transplantation limits ABD ve Japonya’da 1960’lı yıllarda the effectiveness of the intervention. geliştirilmeye başlanan mekanik dolaşım Mechanical circulatory support (MCS) desteği (MDD) sistemleri, son yıllarda systems, which started to be developed gittikçe artan bir sıklıkla tüm dünyada ve in the USA and Japan in the 1960s for ülkemizde gerek transplanta köprü olarak this patient group, are increasingly gerekse yaşam boyu destek sağlamak used in recent years, both as a bridge için kullanılmaktadır. Hemodinamik to transplantation and to provide yetmezliğe giren sol karıncğın hacim lifelong support in our country. Systems yükünü sistemik dolaşıma basan bir consisting of a blood pump that presses kan pompası, pompayı hareket ettiren the volume load of the left ventricle into

03 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Doç. Dr. / Assoc. Prof. Dr. Abdurrahman Kamuran KADIPAŞAOĞLU - TUBITAK 1003 bir eyleyici, pnömatik veya elektromekanik bir güç the systemic circulation, an actuator that moves the kaynağı, kontrol ünitesi ve gref, konektör, kablo gibi pump, a pneumatic or electromechanical power çeşitli aksesuardan oluşan sistemler, günümüzde source, a control unit and various accessories such minyatürize edilmiş, taşınabilir, vücut içi, dayanıklı, as graft, connector, cable, are now miniaturized, güvenilir ve akıllı teknolojilere dönüştürülmüştür. portable, intra-body, has been transformed into Gelişmekte olan diğer ülkeler gibi, Türkiye’de de yerli durable, reliable and smart technologies. Like ve rekabetçi MDD sistemlerinin geliştirilmesi tıbbi, other developing countries, the development of insani ve toplumsal bir ihtiyaç olduğu kadar bilimsel, competitive domestic and MCS systems in Turkey teknolojik ve ekonomik bir gereklilik olarak karşımıza for medical, scientific as well as humanitarian and çıkmaktadır. Önerilen proje, bu soruna yerli ve özgün social needs, technological and emerges as an bir çözüm sunmak amacıyla, yenilikçi bir MDD sistemi economic necessity. The proposed project has been oluşturmak hedefiyle hazırlanmıştır. Tek kademeli bir prepared with the aim of creating an innovative eksenel türbin ve türbin rotorunu hareketlendirilen MCS system in order to offer a local and original fırçasız doğru akım motoru, Destek Sisteminin 1. Temel solution to this problem. A single-stage axial turbine Teknolojisi (TT1) olan Sol Ventrikül Destek Pompası’nın and brushless direct current motor with a turbine (SVDP) iki Alt Bileşenini (AB) oluşturacaktır. rotor will form two Sub-Components (SC) of the Left Ventricle Support Pump (LVSP), which is the 1st Basic Technology (BT1) of the Support System. 5 Dolaşım sistemi benzetim devresi / Circulatory system simulation circuit

04 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR DOÇ. DR. / ASSOC. PROF. DR. AFIFE BINNAZ HAZAR YORUÇ BÖLÜM METALURJI VE MALZEME MÜHENDISLIĞI DEPARTMENT BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI METALLURGICAL AND MATERIALS ENGINEERING START-END DATE 01.11.2019 - 31.10.2021 DESTEK TÜRÜ TUBITAK 1505 FUNDED BY 1.161.221,91 TL BÜTÇESI BUDGET REJENERATIF / ANTIBAKTERIYEL ÖZELLIKLI KOMPOZIT DOLGU MALZEMELERININ GELIŞTIRILMESI VE PERFORMANSININ DEĞERLENDIRILMESI DEVELOPMENT OF REGENERATIVE / ANTIBACTERIAL COMPOSITE FILLERS AND EVALUATION OF THEIR PERFORMANCE www.yildiz.edu.tr Medikal pazarda mevcut olan dental Dental restorative materials available in restoratif malzemeler inert malzemeler the medical market are inert materials olup, kayıp diş dokularının fiziksel olarak and are used to physically repair lost onarılmasında kullanılır. Remineralizasyon dental tissues. Remineralization and ve antibakteriyel özellik kazandırılmış antibacterial properties have very kompozit dolgu malzemeleri, doku advantageous properties such as kayıplarının yenilenmesinde, ikincil regeneration of tissue losses, inhibition çürüklerin inhibisyonunda, biofilm of secondary caries, prevention of oluşumunun önlenmesi, geleneksel biofilm formation, lower cytotoxicity kompozitlere kıyasla daha düşük compared to traditional composites, sitotoksisite göstermesi, dental pulpayı protection of dental pulp and koruması ve dentin oluşumunun stimulation of dentin formation. For uyarılması gibi oldukça avantajlı özelliklere this reason, it is very important to use sahip olmaktadır. Bu sebeple lezyon dental fillers with bioactive properties oluşumlarının tersine döndürülmesi for reversing lesion formations and ve çürük oluşumlarının inhibisyonu inhibiting caries formations. With the

04 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Doç. Dr. / Assoc. Prof. Dr. Afife Binnaz HAZAR YORUÇ - TUBITAK 1505 için biyoaktif özellik kazandırılmış dental dolgu current project, composite filling systems will be malzemelerinin kullanımı oldukça önem taşımaktadır. produced in compositions equivalent to commercial Mevcut proje ile hem piyasada yer alan ticari ürünlere products in the market and these systems will be eşdeğer bileşimlerde kompozit dolgu sistemleri given therapeutic properties. Silica/silane and üretilecek hem de bu sistemlere tedavi edici özellikler silica/zirconia/silane nanocumes will be used as kazandırılacaktır. Destekleyici faz sistemleri olarak supporting phase systems and BHA, Al-Sr-of and silika/silan ve silika/zirkonya/silan nanokümeleri ve al-Sr-Si-of compounds will be used as antibacterial antibakteriyel ajan olarak BHA, Al-Sr-OF ve Al-Sr-Si- agents. Supporting phase systems will be modified OF bileşikleri kullanılacaktır. Destekleyici faz sistemleri with 3-MPTMS. BisGMA, BisHEMA, udma and 3-MPTMS ile modifiye edilecektir. Organik matriks TEGDMA monomers will be used as the organic olarak BisGMA, BisHEMA, UDMA ve TEGDMA matrix. Composites will be produced according to monomerleri kullanılacaktır. Kompozitler Vita Classic the Vita Classic color scale. Since almost all of the renk skalasına uygun olarak üretilecektir. Türkiye'de products belonging to the field of dental materials dental malzeme alanına ait ürünlerin neredeyse are imported in Turkey, the current study has tamamı ithal edildiğinden, mevcut çalışma dental targeted the production of dental fillers with high sektör içinde yer alan ticarileşme potansiyeli yüksek commercialization potential within the dental sector. dental dolgu malzemelerinin üretimini hedeflemiştir. 7

05 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR BÖLÜM PROF. DR. MUHAMMET ARICI DEPARTMENT GIDA MÜHENDISLIĞI / FOOD ENGINEERING BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI START-END DATE 01.10.2013 - 30.06.2015 DESTEK TÜRÜ TUBITAK 1505 FUNDED BY 1.036.041,3 TL BÜTÇESI BUDGET LALE TAÇ YAPRAKLARINDAN PILOT ÖLÇEKLI DOĞAL BOYA ÜRETIMI PILOT-SCALE NATURAL DYE PRODUCTION FROM TULIP PETALS Projenin amacı lale soğanı elde etmek The aim of the project is to develop the production of natural dye from the için koparılıp atılan taç yapraklarından petals that are plucked and discarded to obtain tulip bulbs. For this purpose, doğal boya üretiminin geliştirilmesidir. the drying of the tulip petals and the optimization of the extraction of natural Bu maksatla lale taç yapraklarının dyes were optimized. It has been shown that the anthocyanin content of tulip kurutulması, doğal boya maddelerinin petals is up to 3000 mg/L and this value is an important anthocyanin source ekstraksiyonunun optimizasyonu of tulip petals. Solvent optimization and process design were made for gerçekleştirilmiştir. Lale taç yapraklarının maximum anthocyanin extraction from petals under laboratory conditions. The antosiyanin içeriği 3000 mg/L değerine data obtained as a result of the solvent optimization revealed that a significant kadar çıktığı ve bu değerin lale taç portion of the anthocyanins in the tulip petals are water-soluble. Toxicity tests yapraklarının önemli bir antosiyanin of anthocyanins, anthocyanin profile kaynağı olduğunu göstermiştir. Laboratuvar şartlarında taç yapraklardan maksimum düzeyde antosiyanin ektraksiyonu için solvent optimizasyonu www.yildiz.edu.tr ve proses tasarımı yapılmıştır. Solvent optimizasyonu sonucu elde edilen veriler lale taç yapraklarında bulunan antosiyaninlerin önemli bir kısmının suda çözünebilir olduğunu ortaya koymuştur.

05 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof. Dr. Muhammet ARICI - TUBITAK 1505 Antosiyaninlerin toksisite testleri antosiyanin profili ve and pH and thermal stability of anthocyanins were antosyaninlerin pH ve ısısal stabiliteleri belirlenmiştir. also determined. Anthocyanin profile analysis, on Yapılan antosiyanin profili analizi ise taç yaprakların the other hand, affected the anthocyanin profile of antosiyanin profili lale çeşidinden etkilenmiş, bu the petals, and this situation reveals that the tulip durum boya olarak kullanılacak lale çeşidinin variety to be used as a dye is a very important antosiyanin verimliliği ve stabilite açısından çok önemli parameter in terms of anthocyanin efficiency and bir parametre olduğunu ortaya koymaktadır. Aynı stability. The same trials have been confirmed in denemeler pilot ölçekli sistemlerde de doğrulanmıştır. pilot scale systems. Anthocyanins obtained from Pilot ölçekli üretimden elde edilen antosiyaninler pilot scale production were encapsulated with maltodekstrin ile püskürtmeli kurutucuda enkapsüle maltodextrin in a spray dryer and visualized in a edilmiş ve taramalı elektron mikroskobunda (TEM) scanning electron microscope. It has been shown görüntülenmiştir. Enkapsüle boyaların 50-70 °C that the encapsulated dyes are resistant to thermal sıcaklıktaki ısısal işlemlere dayanıklı olduğunu processes at 50-70 °C. Finally, the stability of the gösterilmiştir. Son olarak optimum şartlarda enkapsüle dyes encapsulated under optimum conditions was edilen boyaların elma ve gül suyuna ilave edilerek determined by adding apple and rose water. stabiliteleri belirlenmiştir. 9

06 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR DOÇ. DR. / ASSOC. PROF. DR. SERAP DERMAN BÖLÜM BIYOMÜHENDISLIK / BIOENGINEERING DEPARTMENT 01.06.2020 - 01.06.2021 BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI TUSEB START-END DATE 908.497,38 TL DESTEK TÜRÜ FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET COVID-19 AŞISINDA KULLANILMAK ÜZERE TÜRKIYE’NIN ANTIJENIK PEPTID / PROTEIN KÜTÜPHANELERININ OLUŞTURULMASI, SPESIFIK ANTIJENIK PEPTID / PROTEINLERIN ÜRETIMI VE AŞI FORMÜLASYONLARI OLARAK İMMÜN YANIT SONUÇLARININ ELDESI GENERATION OF A LOCAL LIBRARY OF ANTIGENIC PEPTIDES / PROTEINS TO USE IN VACCINE DEVELOPMENT STUDIES AGAINST COVID-19, PRODUCTION OF SPECIFIC ANTIGENIC PEPTIDES / PROTEINS AND VACCINE FORMULATIONS WITH DETERMINED IMMUNE RESPONSES COVID-19’a karşı kullanılmak üzere It is aimed to develop a peptide and recombinant protein-based vaccine peptid ve rekombinant protein esaslı formulation to be used against COVID-19. In this context, first of all, bir aşı formülasyonu geliştirilmesi SARS-CoV-2 antigenic peptide epitopes will be determined and analyzed by in amaçlanmaktadır. Bu kapsamda, silico methods. Then, these determined peptide sequences will be produced for öncelikle SARS-CoV-2 antijenik the first time in our country by chemical synthesis with microwave-assisted peptid epitopları in silico yöntemlerle peptide synthesis method in solid phase, and a ready-to-use peptide library will belirlenerek analiz edilecektir. Ardından, be created immediately in SARS-CoV-2 studies. In addition, all antigenic Spike (S) belirlenen bu peptid dizileri katı fazda protein belonging to SARS-CoV-2 and S1 and S2 regions of the related protein mikrodalga destekli peptid sentezi yöntemi ile kimyasal sentez yoluyla ülkemizde ilk defa üretilerek, SARS-CoV-2 çalışmalarında ivedilikle kullanıma hazır www.yildiz.edu.tr bir peptid kütüphanesi oluşturulacaktır. Ayrıca, SARS-CoV-2’ye ait antijenik tüm Spike (S) proteini ve ilgili proteinin S1 ve S2 bölgeleri rekombinant olarak

06 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Doç. Dr. / Assoc. Prof. Dr. Serap DERMAN - TUSEB üretilecektir. Proje kapsamında üretilecek antijenik will be recombinantly produced. Antigenic peptides peptid ve proteinler öncelikle in vitro olarak ardından and proteins to be produced within the scope of da in vivo olarak incelenerek en yüksek immün yanıt the project will be examined first in vitro and then in oluşturan formülasyon belirlenecektir. En son olarak vivo, and the formulation that produces the highest ise en yüksek immün yanıt gösteren formülasyonun immune response will be determined. Finally, the virüs nötralizasyon çalışması ve SARS-CoV-2’ye karşı virus neutralization study of the formulation showing koruyuculuk çalışması yapılması hedeflenmiştir. the highest immune response and a protective study against SARS-CoV-2 were aimed. 11 SARS-CoV-2 S Proteini Antijenik Peptid Dizileri

07 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR BÖLÜM DOÇ. DR. /ASSOC. PROF. DR. FATIH TÖRNÜK DEPARTMENT GIDA MÜHENDISLIĞI / FOOD ENGINEERING BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI START-END DATE 01.02.2015 - 31.12.2016 DESTEK TÜRÜ TUBITAK 1505 FUNDED BY 885.616,25 TL BÜTÇESI BUDGET EKMEKLIK UNLARIN PELEMIR (CEPHALARIA SYRIACA L.) İLE KUVVETLENDIRILMESI: PELEMIR TOHUMUNUN KARAKTERIZASYONU, ACILIĞIN GIDERILMESI VE EKMEKÇILIK KALITESINI ARTIRMASI BAKIMINDAN DEĞERLENDIRILMESI FORTIFICATION OF WHEAT FLOURS WITH CEPHALARIA SYRIACA: CHARACTERIZATION OF CEPHALARIA SEEDS, REMOVAL OF ITS BITTERNESS AND EVALUATION OF ITS EFFECT ON INCREASE OF BREADMAKING QUALITY OF FLOURS Bu proje, Türkiye’de üretilen buğdaylarda This project was carried out to reveal the role of the cephalaria (Cephalaria görülen yaygın bir problem olan kalite syriaca) in eliminating the poor quality of wheats, which is a common problem in düşüklüğünün ortadan kaldırılmasında Turkey, and to obtain a natural, effective and non-toxic additive from cephalaria pelemir (Cephalaria syriaca) bitkisinin that improves the dough/bread quality. Cephalaria is a wild crop which has a rolünün ortaya konulması ve pelemirden similar grain structure to wheat and is traditionally used to strengthen the hamur/ekmek kalitesini iyileştirici doğal, weak dough used traditionally in bread making by people living in rural areas etkili ve toksik olmayan bir katkı maddesi in our country and therefore allowed to grow in wheat fields. However, some elde etmek amacıyla yürütülmüştür. constituents of cephalaria give bitterness and dark color to the incorporated Pelemir, özellikle ülkemizde kırsal kesimlerde yaşayan insanlar tarafından ekmek yapımında kullanılan zayıf hamurların kuvvetlendirilmesinde www.yildiz.edu.tr geleneksel olarak kullanılan ve bu yüzden buğday tarlalarında yetişmesine izin verilen, tane yapısı buğdaya oldukça benzeyen yabani bir bitkidir. Bununla

07 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Doç. Dr. / Assoc. Prof. Dr. Fatih TÖRNÜK - TUBITAK 1505 birlikte, pelemir belli bir düzeyde kullanıldığı zaman product. Therefore, the aim of this work was to ürüne acılık veren ve rengini koyulaştıran bileşenlere obtain extracts with high dough-strengthening sahiptir. Bu projenin amacı, pelemirden acılığı ve koyu effect and bitterness and dark color disadvantage renk dezavantajı giderilmiş, hamur kuvvetlendirici of which was eliminated. The outputs of the project etkisi yüksek özütlerin elde edilmesi olmuştur. Proje studies were patented by the commercial partner çalışmaları sonucunda elde edilen çıktılar, müşteri organization and commercialized as “ceplalaria- kuruluş tarafından patent altına alınmış ve “pelemir added wheat flour”. katkılı buğday unu” şeklinde ticarileştirilmiştir. 13

08 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR BÖLÜM PROF. DR. SEVIL YÜCEL DEPARTMENT BIYOMÜHENDISLIK / BIOENGINEERING BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI START-END DATE 01.09.2017 - 2021 DESTEK TÜRÜ TAGEM FUNDED BY BÜTÇESI 553.328 TL BUDGET TARIMSAL ATIKLARDAN ELDE EDILEN NANOGÖZENEKLI SILIKA AEROJELLERIN GIDA KATKI MADDESI OLARAK DEĞERLENDIRILMESI IÇIN OPTIMIZASYON ÇALIŞMALARININ VE IN VITRO HÜCRE TESTLERININ YAPILMASI OPTIMIZATION STUDIES AND IN VITRO CELL TESTS FOR THE EVALUATION OF NANOPOROUS SILICA AEROGELS OBTAINED FROM AGRICULTURAL WASTES AS FOOD ADDITIVES www.yildiz.edu.tr Bu çalışmada, pirinç kabuğu külünden In this study, nanoporous silica aerogel sodyum silikat çözeltisi elde edilerek synthesis will be carried out by sol-gel sol-jel yöntemiyle nanogözenekli silika method by obtaining sodium silicate aerojel sentezi gerçekleştirilecektir. solution from rice husk ash. Optimization Nanogözenekli silika aerojel üretimine studies will be carried out by examining etki eden parametreler incelenerek the parameters that affect the production optimizasyon çalışmaları yapılacaktır. of nanoporous silica aerogel. For this Bu amaçla jelleşme için kullanılan purpose, optimization experiments will asitler (HCl, H2SO4 ve HNO3), kullanılan be conducted to determine the optimum tuzlar (klorlu, nitratlı ve sülfatlı tuzlar), values of acids (HCl, H2SO4 and HNO3) silika/tuz oranı, yaşlandırma sıcaklığı used for gelation, salts used (chlorinated, parametrelerinin optimum değerlerini nitrated and sulphated salts), silica / salt saptamak için optimizasyon deneyleri ratio, aging temperature parameters. yapılacaktır. Bunlara ek olarak E 551 ve In addition to these, silicate varieties E 559 arasında yer alan silikat çeşitleri between E551 and E559 (Calcium (Kalsiyum silikat, Magnezyum silikat, silicate, Magnesium silicate, Sodium

08 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof. Dr. Sevil YÜCEL - TAGEM Sodyum alüminyum silikat, Potasyum alüminyum aluminum silicate, Potassium aluminum silicate, silikat, Kalsiyum alüminyum silikat, Alüminyum silikat) Calcium aluminum silicate, Aluminum silicate) will saptanan optimum şartlarda silika aerojeller olarak be produced as silica aerogels under determined üretilecektir. optimum conditions. Karakterizasyon çalışmaları sonucunda uygun olan As a result of characterization studies, suitable aerojeller toz tarhana ve toz içecek içerisinde belirli aerogels will be used with certain amounts in miktarla kullanılarak viskozite testleri gerçekleştirilerek powdered tarhana and powdered beverage, akış davranışları incelenecek ve piyasada kullanılan E and viscosity tests will be carried out, their flow kodlu ticari silikalar ile karşılaştırılacaktır. MTT hücre behavior will be examined and compared with canlılığı ve sitotoksisite testleri yapılarak üretilen commercial silicas with E code used in the market. malzemenin güvenilirliği saptanacaktır. LDH enzim The reliability of the produced material will be salımları takip edilerek sitotoksisitesi ile ilgili net bir determined by performing MTT cell viability and yorum yapılacaktır. Ayrıca gıda güvenliğinin net cytotoxicity tests. A clear interpretation will be made bir şekilde ortaya koyulması için hayvan testleri about the cytotoxicity by monitoring LDH enzyme (genişletilmiş akut sistemik toksisite testleri) de releases. In addition, animal tests (extended acute yapılacaktır. systemic toxicity tests) will be conducted to clearly demonstrate food safety. 15

09 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ PROF. DR. BESTAMI ÖZKAYA PRINCIPAL INVESTIGATOR ÇEVRE MÜHENDISLIĞI / ENVIRONMENTAL ENGINEERING BÖLÜM DEPARTMENT 01.06.2014 - 01.06.2017 BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI AB / EU START-END DATE DESTEK TÜRÜ 463.264 TL FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET DÜŞÜK MALIYETLI VE YÜKSEK VERIMLI MIKROBIYAL YAKIT HÜCRESI (MYH) MALZEMELERI ILE ATIKSULARDAN BIYOELEKTRIK ÜRETIMI PRODUCTION OF BIOELECTRICITY FROM WASTEWATER USING LOW COST AND EFFICIENT MICROBIAL FUEL CELL (MFC) MATERIALS www.yildiz.edu.tr Son yıllarda enerji ihtiyaçlarını karşılamak için In recent years the use of fossil fuels to meet fosil yakıtların kullanımındaki artış çevresel energy needs increased environmental problemleri hızlandırmış, yenilenebilir enerji problems and the demand for renewable kaynaklarına ve teknolojilerine olan talep energy sources and technologies has steadily giderek artmıştır. Bu durum bilim dünyasında increased. In this case, the science world has yapılan çalışmaları alternatif enerji kaynakları led to the search for new alternative energy arayışına yönlendirmiştir. Rüzgar ve güneş sources. The bioenergy as an alternative to enerjisi gibi yenilenebilir enerji kaynaklarına renewable energy sources like wind and solar alternatif olarak, biyoenerji gelecekte en önemli energy will become one of the most important enerji kaynaklarından biri haline gelecektir. energy source in the future. Microbial fuel cell Mikrobiyal Yakıt Hücreleri (MYH) yenilenebilir (MFC) is a new method used for renewable enerji kazanımı için kullanılan yeni bir yöntemdir. energy recovery. MFCs can be used in MYH sistemleri, atıksu arıtımının yanında eş wastewater treatment and to simultaneously zamanlı olarak elektrik enerjisinin üretildiği arıtma produce electricity (renewable energy) and this teknolojisi olarak bilinmekte olup klasik sistemlere technology has many advantages compared nazaran birçok avantajı bulunmaktadır. MYH’nin to conventional systems.

09 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof Dr. Bestami ÖZKAYA - AB / EU en temel üstünlükleri; (1) anaerobik bir sistem olduğundan daha az The main advantages of MFC: (1) less sludge production çamur üretimi, (2) temiz ve yenilenebilir olması, 3) sıfır kirletici olması (compared to a anaerobic system), (2) clean and renewable şeklinde sıralanabilir. and (3) having zero pollutants. Despite the advantages of Bu sistemlerin sahip olduğu avantajlara karşın MYH’de üretilen these systems MFCs have not yet reached sufficient electricity enerji miktarının yeterli düzeylere henüz ulaşmaması ve kullanılan production and high prices of materials restrict the applicability malzeme fiyatlarının yüksek olması büyük ölçekte uygulanabilirliğini of large scales MFCs. To be commercially viable MFCs, there kısıtlamaktadır. MYH’nin ticari olarak uygulanabilir olması için daha is a need for the development of more cost effective and more düşük maliyetli ve daha verimli, elektrot ve ayırıcı maddelerin efficient electrodes and seperators. Requirements for the electrode geliştirilmesine ihtiyaç duyulmaktadır. Elektrot malzemelerinde material have been identified as high electrical conductivity, ihtiyaç duyulan gereksinimler yüksek elektrik iletkenliği, yüksek high surface area/volume ratio, biocompatibility, corrosion yüzey alanı/hacim oranı, biyolojik uyumluluk, korozyona karşı direnç resistance and suitability for large-scale applications, respectively. ve büyük ölçekli uygulamalara uygunluk olarak belirlenmiştir. Bu This however can be achieved by a combination of different ancak malzeme bilimi, elektrokimya, biyomühendislik, mikrobiyoloji, disciplines as materials science, electrochemistry, bioengineering, moleküler biyoloji ve atıksu arıtımı gibi bilim dallarının kombinasyonu microbiology, molecular biology and environment engineering. ve eşzamanlı ilerlemesiyle sağlanabilir. Elektrik üretiminde daha The use of carbon-based materials and platinum oxide instead verimli anot malzemelerinin geliştirilmesi amacıyla karbon bazlı of manganese for modifying the surfaces of anode material to malzemelerin yüzeylerinin modifiye edilmesi ile ilgili birçok deneme generate more efficient electricity are examples of this case. Also yapılmış olup platin yerine mangan oksitlerin kullanılması buna bir separators used between the anode and cathode compartments örnektir. Anot ve katot bölmeleri arasında kullanılan ayırıcılarında must be improved. The separators should support proton transfer iyileştirilmesi gerekmektedir. Ayırıcılar proton transferini desteklemeli and should prevent oxygen diffusion from the cathode to the anode ve katottan anota doğru oksijen difüzyonunu engellemelidir. Test compartement. Cation exchange membranes, membrane-based edilecek olan ayırıcılar arasında katyon değişim membranlar, hidrofilik separators and low cost binder materials and catalysts modified membran bazlı ayırıcılar ve düşük maliyetli bağlayıcı malzemeler ve gas diffusion membranes can be listed as seperators in MFCs. katalizörlerle modifiye edilebilen gaz difüzyon membranları sayılabilir. The project aims are summarized in; (i) low cost and highly 17 Bu projede özetle, i) düşük maliyetli ve yüksek verimli MYH efficient material production, (ii) Integration of electrodes with malzemelerinin üretilmesi, ii) üretilen malzemelerin MYH ile MFC, (iii) testing MFC performance using advanced techniques entegrasyonu, iii) MYH performansının ileri tekniklerle test edilmesi and ensuring prolonged use and (iv) microbial community change ve uzun süreli kullanımın sağlanması, iv) farklı elektrot malzemelerine according different electrode materials. bağlı olarak mikrobiyal türlerin değişiminin belirlenmesi amaçlanmıştır. In this scope, carbon supported Pt and binary Pt-M (M=Co, Bu kapsamda, MYH’nin katot kısmında kullanılmak üzere karbon Mn and Ni) alloys for use on cathode side of the fuel cell were destekli Pt ve ikili Pt-M (M=Co, Mn ve Ni) alaşımları karbon ile metal prepared by reduction of carbon and metal ion with NaBH4 iyonlarının eş zamanlı NaBH4 ile indirgenmesiyle hazırlanmıştır. simultaneously. The electrochemical properties of the electrodes Farklı şartlarda hazırlanan elektrotların elektrokimyasal özellikleri, prepared under different conditions were determined prior the tests yakıt hücresi testlerinden önce, Döngüsel Voltametri, Döner Disk of the fuel cell with cyclic voltammetry, rotating disc electrode, Elektrot, Lineer Tarama Voltametri ve Elektrokimyasal Empedans linear sweep voltammetry and electrochemical impedance Spektroskopisi yöntemleri ile belirlenmiştir. Fiziksel özellikler ise SEM, spectroscopy methods. Physical characteristics were examined TEM, XRD, XPS, TGA ve FT-IR gibi güçlü karakterizasyon yöntemleri by characterization methods such powerful SEM, TEM, XRD, XPS, ile incelenmiş ve istenilen özellikleri sağlayan elektrotlar MYH’de FT-IR and TGA and electrodes that provide desired properties were katot elektrodu olarak kullanılmıştır. used as cathode electrode in MFCs. Düşük maliyetli – yüksek verimli elektrot ve ayırıcı malzemeler By developing low cost - highly efficient electrodes and separator kullanılarak yeni bir MYH tasarımının gerçekleştirilmesi ile devam materials of MFC design, energy recovery through the use of eden çalışmalar sayesinde yenilenebilir malzemelerin enerji içeriğinin organic materials were provided a significant contribution to toplanabilmesi için biyoelektrokimyasal sistemlerin geliştirilmesi waste management. sağlanmış olup, enerji geri kazanımı için organik maddelerin kullanımı sayesinde atık yönetimine de önemli katkılar sağlanmıştır.

10 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ PROF. DR. BESTAMI ÖZKAYA PRINCIPAL INVESTIGATOR ÇEVRE MÜHENDISLIĞI / ENVIRONMENTAL ENGINEERING BÖLÜM DEPARTMENT 01.06.2013 - 31.05.2015 BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI SANTEZ START-END DATE DESTEK TÜRÜ 443.800 TL FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET MIKROALG KÜLTÜRÜNÜN SÜRDÜRÜLEBILIR ENERJI ÜRETIMI VE SERA GAZI MITIGASYONUNDA KULLANIMI SUSTAINABLE ENERGY PRODUCTION OF MICROALGAE CULTURE AND GREENHOUSE GAS TO BE USED IN MITIGATION Nüfus artışı ve sanayinin gelişimine In parallel with population growth and industrial development, the need for paralel olarak enerjiye olan ihtiyaç da energy is also increasing. Due to the rapid consumption of fossil fuels and their harmful artmaktadır. Fosil yakıtların hızla tüketilmesi effects on the environment, interest in alternative energy sources is increasing ve çevreye olan zararları sebebiyle day by day. The use of renewable energy sources is regarded as an attractive and alternatif enerji kaynaklarına olan ilgi gün important solution that ensures sustainable energy supply. Energy agriculture is the most geçtikçe artmaktadır. Enerji temininde common method among the renewable energy sources, but its most important sürdürülebilirliğin sağlanabilmesi weakness is its competition with food products, especially in our country. In this maksadıyla yenilenebilir enerji kaynaklarının context, microalgae production is a method that can be an alternative to existing energy kullanımı cazip ve önemli bir çözüm olarak görülmektedir. Enerji tarımı yenilenebilir enerji kaynakları arasında uygulanan en yaygın yöntem olup en önemli zayıflığı www.yildiz.edu.tr ise özellikle ülkemizde gözlenen gıda ürünleri ile rekabet halinde olmasıdır. Bu kapsamda mikroalg üretimi mevcut enerji bitkilerine alternatif olabilecek bir

10 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof Dr. Bestami ÖZKAYA - SANTEZ yöntemdir. Yetiştirilmesi için enerji bitkilerine oranla crops. Due to its advantages such as needing 35% less 19 %35 daha az alana ihtiyaç duyulması, fotofermentasyon area compared to energy plants for its cultivation, and yaparak karbondioksit kaynaklı sera gazı azaltımı gibi reducing greenhouse gas caused by carbon dioxide by üstünlüklerinden dolayı geleceğin önemli bir enerji photofermentation, it is thought that it will be an important kaynağı olacağı düşünülmektedir. source of energy future. Katı atık bertaraf tesislerinden çıkan CO2, önemli sera CO2 from solid waste disposal facilities causes significant gazı salınımlarına sebep olmaktadır. Proje kapsamında, greenhouse gas emissions. Within the scope of the mikroalgler kullanılarak, inorganik karbon kaynağı olarak project, it is aimed to use CO2 in the flue gas as an kullanılacak baca gazındaki CO2 ile karbon salınımını inorganic carbon source to reduce carbon emissions by azaltmak ve azot ve fosfor kaynağı olarak kullanılacak using microalgae, and to remove nutrients with leachate sızıntı suyu ile nutrient giderimi hedeflenmektedir. serving as a source of nitrogen and phosphorus. Projemizin nihai gerçekleşme raporunda, iş paketlerinde In the final realization report of our project, in line with the belirlemiş olduğumuz çalışmalardoğrultusunda; studies we have determined in the work packages; • Proje konusu ile ilgili yayınlanmış eserler büyük ölçüde • The works published on the subject of the project derlenmiş ve oldukça iyi bir literatür oluşturulmuştur. have been compiled to a great extent and a very good • Proje kapsamında yapılacak laboratuvar analizleri literature has been created. belirlenerek, analizlerin rutin olarak yapılabilecek hale • The ability to perform routine analysis has been provided gelmesi sağlanmıştır. by determining the laboratory analyzes to be performed • Çalışmada kullanılacak, İstanbul Büyükşehir Belediyesi within the scope of the project. İSTAÇ A.Ş. tarafından işletilen Düzenli Depolama • In the study, characterization of the effluent obtained Tesisi Sızıntı Suyu Membran Tesisi çıkış suyunun from a Regular Storage Facility Leachate Membrane karakterizasyonu yapılmıştır. Facility operated by Istanbul Metropolitan Municipality • Mikroalg kültürleri temin edilerek, laboratuvar İSTAÇ A.Ş. has been made. ortamında yürütülen kesikli çalışmalarla mikroalglerin, • Extensive studies were carried out for the cultivation yetiştirilmesine ve sızıntı suyunda azot-fosfor giderimine of microalgae and nitrogen-phosphorus removal in yönelik kapsamlı çalışmalar gerçekleştirilmiştir. leachate with batch studies conducted in the laboratory • Çalışmada kullanılacak laboratuvar ölçekli plaka, environment by procuring microalgae cultures. yarış pisti ve tübüler biyoreaktör sistemleri kurulmuş, • The laboratory scale plate, race track and tube sistemler kesikli olarak işletilmiştir. İSTAÇ A.Ş.’de pilot bioreactor systems to be used in the study were set up ölçekli fotobiyoreaktörlerin (tübüler, raceway) kurulumu and the systems were operated in batches. Pilot scale gerçekleşmiş, sistemler kesikli olarak işletilmiştir. photobioreactors (tubular, raceway) were set up at İSTAÇ • İSTAÇ A.Ş.’de yürütülecek pilot ölçekli çalışmalarda A.Ş. and the systems were run in batches. optimum büyüme şartlarının sağlanabilmesi için • In order to provide optimum growth conditions in the kurulacak seranın plan, çizim ve teknik şartnamesi pilot scale studies to be carried out at İSTAÇ A.Ş., the plan, hazırlanmıştır. drawing and technical specifications of the greenhouse • Yürütülecek pilot ölçekli çalışmalarda optimum to be set up have been prepared. büyüme şartlarının sağlanabilmesi için İSTAÇ A.Ş.’de • In order to ensure optimum growth conditions in the sera kurulmuştur. pilot scale studies to be carried out, a greenhouse has • Laboratuvar ölçekli biyoreaktörler ile kültüvasyon been set up at İSTAÇ A.Ş. çalışmaları tamamlanmıştır. • Cultivation studies with laboratory scale bioreactors • Mikroalglerin enerji potansiyelleri araştırılmıştır. have been completed. Biyoelektrik üretim verimleri incelenmiştir. Yağ • The energy potential of microalgae has been ekstraksiyonundan çıkan biyokütlenin biyometan researched. Bioelectric production efficiencies have been potansiyeli belirlenmiştir. examined. The biomethane potential of the biomass from • Mikroalglerin yağ içerikleri belirlenmiştir. oil extraction was determined. • Laboratuar ölçekli (çapraz akışlı, dead-end ve • The oil contents of microalgae have been determined. batık) membran sistemlerin kurulumları yapılarak bu • Laboratory-scale (cross-flow, dead-end and sistemlerde mikroalg hasat işlemleri gerçekleştirilmiştir. submerged) membrane systems were installed and • Mikroalgal kültürün tür tanımlanması ışık mikroskobu microalgae harvesting operations were performed in ile gerçekleştirilerek boyutları tespit edilmiştir. these systems. • Çalışma sonunda enerji sarfiyatları, ekonomik analiz ve • Species identification of the microalgal culture was değerlendirme yaşam döngüsü analizi ile incelenmiştir. performed with a light microscope and their dimensions were identified. • At the end of the study, energy consumption was analyzed with economic analysis and evaluation life cycle analysis.

11 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ PROF. DR. MEHMET SINAN BİLGİLİ PRINCIPAL INVESTIGATOR ÇEVRE MÜHENDISLIĞI / ENVIRONMENTAL ENGINEERING BÖLÜM DEPARTMENT 01.05.2013 - 01.05.2016 BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI TUBITAK 1001 START-END DATE 416.640 TL DESTEK TÜRÜ FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET BIYOREAKTÖR DEPO SAHALARINDA NANOMALZEMELERIN DAVRANIŞLARI VE ATIKLARIN AYRIŞMA PROSESLERI ÜZERINDEKI ETKILERININ ARAŞTIRILMASI THE FATE OF NANOMATERIALS IN BIOREACTOR LANDFILLS AND THEIR EFFECTS ON SOLID WASTE DEGRADATION www.yildiz.edu.tr Bu çalışmanın amacı, nanoteknoloji The aim of this study is to indicate alanında ürün geliştirmede yaygın bir the behaviors, transportations and şekilde kullanılan nanogümüş (AgNP) transformations of nano-silver (AgNP) ve titanyum dioksit (TiO2) partiküllerinin and titanium dioxide (TiO2) particles, aerobik ve anaerobik biyoreaktör depo which are widely used in nano- sahaları ile klasik depo sahalarındaki technological product development, davranışları, taşınımları ve dönüşümlerinin in aerobic and anaerobic bioreactor belirlenmesidir. landfills and conventional landfills. Proje süresince nano gümüş (AgNP) The behavior, transportation and ve TiO2 partiküllerinin aerobik ve transformations of nano-silver anaerobik biyoreaktörler ile klasik depo (AgNP) and titanium dioxide (TiO2) sahalarındaki davranışları, taşınımları nanoparticles in aerobic and anaerobic ve dönüşümleri ile bunların sızıntı bioreactors and also conventional suyu özellikleri üzerindeki etkileri landfills, and their effects on leachate araştırılarak klasik depolama yöntemleri were investigated during the project. ile karşılaştırıldığında meydana gelen In addition, interactions of AgNP

11 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof. Dr. Mehmet Sinan BİLGİLİ - TUBITAK 1001 farklılıklar ortaya konulmuştur. Bunun dışında, AgNP and TiO2 particles with organic and inorganic ve TiO2 partiküllerinin sızıntı suyu ve katı atık kütlesi pollutants in leachate and solid waste samples were içerisindeki organik ve inorganik kirleticilerle olan investigated, and effective microorganism species etkileşimleri araştırılmış ve ayrışma prosesleri sırasında during decomposition process and the effect of depo gövdesinde etkin mikroorganizma türleri tespit nanomaterials on these species were identified. edilerek nano malzemelerin türler üzerindeki etkileri Also, transportation potential of nanoparticles to incelenmiştir. Ayrıca, depo sahası tabanından geçiş groundwater and surface water from landfills were ve saha tabanının nanopartikülleri tutma kapasitesi determined by the determination of the migration belirlenerek bu partiküllerin yeraltı suyuna ve oradan through landfill bottom liner, and the nano-particle yüzeysel sulara karışma potansiyeli belirlenmiştir. holding capacity of landfill bottom liner was Bu bağlamda, bu projenin gerçekleştirilmesi ile investigated. dünyada ilk kez bu kadar kapsamlı bir şekilde nano In this context, an extended study on determination malzemelerin düzenli depo sahalarındaki davranışları, of behavior of nanomaterials in sanitary landfill bu malzemelerin ayrışma prosesleri ve ayrışmayı sites, determination of the effects of these materials gerçekleştiren mikroorganizma türleri üzerindeki on decomposition processes and microorganism etkileri, sızıntı suyu ve katı atık özelliklerinde yol species, determination of the changes occurred açabileceği değişikliklerin belirlenmesi ve depo sahası in leachate and solid waste characteristics, and tabanından yeraltı sularına geçişinin incelenmesi ile examination of migration through landfill bottom ilgili bir çalışma gerçekleştirilmiştir. liner were determined for the by this project. 21

12 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR DR. ÖĞR. / ASST. PROF. DR. HÜSEYIN ÜVET BÖLÜM MEKATRONIK MÜHENDISLIĞI DEPARTMENT BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI MECHATRONICS ENGINEERING START-END DATE 01.06.2014 - 01.07.2017 DESTEK TÜRÜ TUBITAK 1001 FUNDED BY 410.719,7 TL BÜTÇESI BUDGET MIKRO-ROBOT KOLU DIZAYNI, ÜRETIMI VE GÖRSEL GERI BESLEME ILE TEMASSIZ MANIPÜLASYONU DESIGN / IMPLEMENTATION OF A MICRO-ROBOTIC ARM AND NON-CONTACT MANIPULATION WITH VISUAL SERVOING www.yildiz.edu.tr Bu projenin amacı mikro boyuttaki The project aims to develop a micro- biyolojik hücrelerin ve objelerin robotic arm, which has high accuracy manipülasyonunu yapabilecek, yüksek actuation and manipulation capacity, hassasiyet ve hareket kabiliyetine to manipulate micro-level objects on sahip bir mikro-robot kolu dizaynı ve a microfluidic chip in a non-contact üretimidir. Literatürde ilk kez Buoyant manner. To achieve high accuracy and Kuvvetinden faydalanılarak sıvı içinde precise movement of the micro-robotic manipülasyon yüzeyiyle temasın sıfıra arm in a liquid, Buoyant Force is going indirilmesi ve bu sayede robot kolunun to be utilized with Magnetic Field Force manyetik alan etkisiyle temassız olarak to levitate the micro-robotic arm from yüksek hassasiyette hareket ettirilmesi the surface of the microfluidic chip. This hedeflenmektedir. Mikro-robot kolu approach gives a vital advantage to nano üretim teknikleri kullanılarak nikel eliminate possible friction problems of kaplı polimer bir malzeme ile üretilecektir. the robotic arm with surfaces of the chip Mikro-robot kolu lab-on-a-chip and maintain non-contact manipulation sistemlerde (mikroakışkan kanallara ve in a microfluidic assembly. To the best of

12 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Dr. Öğr. Üyesi / Asst. Prof. Dr. Hüseyin ÜVET - TUBITAK 1001 odalara sahip mikro-çiplerde) çalışmaya uygun our knowledge, those forces will be tested to levitate olarak dizayn edilecek olup, bu çiplerin içine entegre a robotic arm structure and manipulate it with high edilmesini sağlayacak üretim tekniklerine yine bu accuracy in a liquid environment for the first time. proje kapsamında çalışılacaktır. Projede üretilecek The micro-robotic arm will be fabricated with nickel robot kolunun hareket kontrolü görsel geri besleme coated polymer. It will be ready to integrate on the (visual servoing) yöntemleri ile sağlanacak olup, buna microfluidic chip, in other meaning, a Lab-on-a-chip uygun bir görüntü işleme algoritması geliştirilecektir. system for further novel system development in the field of biomedical engineering and biotechnology. Visual Servoing techniques will be engaged with the entire robotic lab-on-a-chip systems to minimize the error that the micro-robotic arm’s positioning can cause with a magnetic field. For this purpose, a computer vision algorithm will be developed during the project and run with the whole system at the end (3 years). 23 Boyutlarla birlikte deneysel düzeneğin tamamını gösterir. Kaldırıcı mıknatısının takılı olduğu motorlu mikro kademenin kontrolü, Visual C #.Net platformunda (Microsoft Corporation, Redmond, WA, ABD) programlanmış bir kontrol arayüzü ile gerçekleştirilir. Kamera görüntüsü aynı anda aynı arayüze aktarılır. Lazer yer değiştirme sensörünün verileri, sensörlerin kendi arayüzü aracılığıyla elde edilir. Shows the whole experimental setup with dimensions. The control of the motorized micro stage where lifter magnet is attached, is realized through a control interface programmed in Visual C#.Net platform (Microsoft Corporation, Redmond, WA, USA). Camera image is transferred to the same interface simultaneously. The data of laser displacement sensor is acquired through the sensors' own interface.

13 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR PROF. DR. CENGIZ KAYA BÖLÜM METALURJI VE MALZEME MÜHENDISLIĞI DEPARTMENT METALLURGICAL AND MATERIALS ENGINEERING BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI 15.11.2009 - 15.01.2013 START-END DATE TÜBİTAK ULUSLARARASI / TUBITAK INTERNATIONAL DESTEK TÜRÜ FUNDED BY 393.135 TL BÜTÇESI BUDGET NANO-YAPILI ANTİMİKROBİYAL KAPLAMALARIN ÜÇ BOYUTLU METALİK FİLTRELER ÜZERİNE ELEKTROKİNETİK BİRİKTİRME YÖNTEMİ KULLANILARAK ELDESİ VE KARAKTERİZASYONU PROCESSING AND CHARACTERIZATION OF ANTIMICROBIAL NANO-STRUCTURED COATINGS ON 3-D METALLIC FILTERS USING ELECTROPHORETIC DEPOSITION Bu proje kapsamında dünyada ilk kez, First time to date, this project investigates the development ofantimicrobial coating nano-yapılı antimikrobiyal tabakaların, layers on 3-D metallic filters using sol-gel and hydrothermally synthesised nano üç boyutlu metalik filtreler üzerine powders by electrophoretic deposition technique as an attempt to stop and kill elektrokinetik biriktirme yöntemi bird flu viruses, H5N1 and bacterias. The current projected worstcase scenario for kullanılarak oluşturulması araştırılmıştır. Bu a H5N1 pandemic is somewhere around 150,000,000 human deaths directly kapsamda özellikle yüzyılımızın en büyük due to H5N1 infection as reported by the World Health Organisation. Coated salgın hastalığı olma potansiyeline sahip metallic filters can be used in air conditions and air circulation systems ve Dünya Sağlık Örgütü’nün hazırladığı in aeroplanes, trains, buses, airports, all public transportation vehicles as well as rapora göre dünya genelinde 150 milyon insanın ölümüne yol açabilecek çok değişik virüslerin (kuş gribi virüsleri de (H5N1) dahil) ve bakteriler www.yildiz.edu.tr üzerinde çalışılmıştır. Bu filtreleri içeren havalandırma ve klima gibi çok değişik sistemlerin, ulusal ve uluslararası seyahat yapan uçaklarda, trenlerde, gemilerde,

13 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof. Dr. Cengiz KAYA - TÜBİTAK ULUSLARARASI / TUBITAK INTERNATIONAL hava alanlarında, tüm toplu taşıma araçlarında ve large areas where animals are kept in order to stop, kanatlı hayvanların saklandığı yerlerde kullanılmasıyla catch and kill the viruses and bacterias. In the project, bu virüs ve bakterilerin hem bölgesel taşınması products suitable to catch and eliminate viruses/ engellenecek ve hem de buralarda var olan virüslerin/ bacterias in liquid environment (such as drinking bakterilerin etkisiz hale getirilmesi sağlanmış olacaktır. water) will also be developed. During the first stage Proje kapsamında ilk olarak nano-boyutlardaki anti- of the project, nano-size powders were synthesised viral/bakteriyal özellik taşıyan nanotozlar sol-jel ve using sol-gel technique and various characterisation hidrotermal yöntemlerle sentezlenenip karakterize techniques will be used for the characterisation of edilmiştir. Bu aşamayı takiben projenin ikinci the obtained powders. This activity was followed aşamasında sentezlenen nano-tozların kullanılmasıyla by the preparation of water-based stable colloidal elde edilen su-alkol bazlı kolloidal çözeltilerden suspensions suitable for coating of 3-D metallic elektrokinetik biriktirme yöntemi kullanılarak üç filters using electrophoretic deposition. In the final boyutlu metalik filtreler üzerinde nano-yapılı stage of the project, characterisation studies, such kaplama tabakalarının elde edilmesi gerçekleştirilmiş as physical and antiviral/-bacterial properties of the ve üçüncü, son aşamada ise kaplanan metalik coated layers were undertaken. filtrelerin anti-viral/-bakteriyal özellikleri detaylı olarak incelenmiştir. a 25 b c Sentezlenen nano Ag-TiO2 tozlarla kaplanarak elde edilen antiviral filtre (a,b) ve yüz maskesi tasarımı (c). Antiviral filter (a, b) and face mask design (c) obtained by coating with synthesized nano Ag-TiO2 powders.

14 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ PROF. DR. GÜLEDA ENGİN PRINCIPAL INVESTIGATOR ÇEVRE MÜHENDISLIĞI / ENVIRONMENTAL ENGINEERING BÖLÜM DEPARTMENT 15.05.2013 - 15.11.2015 BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI TUBITAK 1001 START-END DATE 383.561 TL DESTEK TÜRÜ FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET MEMBRAN BIYOREAKTÖRLERDE EPS’NIN MEMBRAN KIRLENMESI ÜZERINE ETKISININ REOLOJIK PARAMETRELER ILE BELIRLENMESI DETERMINATION THE EFFECT OF EPS ON MEMBRANE FOULING WITH RHEOLOGICAL PARAMETERS IN MEMBRANE BIOREACTORS www.yildiz.edu.tr Evsel ve endüstriyel atıksularının The use of submerged membrane arıtımında batık membran biyoreaktörlerin bioreactors for the purpose of municipal kullanımı son yıllarda ciddi bir şekilde and industrial wastewater treatment artış göstermiştir. MBR’lerde membran have increased significantly over the tıkanmasını etkileyen pek çok bileşen last few years. Although there are a olmasına karşın en önemli kirleticiler, number of components that affect mikroorganizmalar tarafından salgılanan membrane fouling, the most important hücredışıpolimerikmaddelerveçözünmüş membrane fouling parameters are mikrobiyal ürünlerdir. EPS bileşenlerinin extracellular polymeric substances and üretimi, atıksuyun karbon/azot oranından soluble microbial product secreted by önemli derecede etkilenmektedir. EPS ve microorganisms. The production of EPS SMP konsantrasyonları da özellikle flok components are affected significantly oluşumunu, flok boyutunu, aktif çamur by the carbon/nitrogen ratio of floklarının göreceli hidrofobisitesini ve wastewater. The concentrations of EPS zeta potansiyelini etkilemektedir. Ayrıca and SMP values influence flocculation, EPS’ler MLSS konsantrasyonu ile birlikte floc size, relative hydrophobicity and

14 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof. Dr. Güleda ENGİN - TUBITAK 1001 aktif çamurun reolojik özelliklerini de değiştirmektedir. zeta potential of activated sludge. In addition, EPS Bu projede, batık MBR’de, farklı çamur yaşlarında ve production alters the MLSS concentration as well as her bir çamur yaşında 3 farklı C/N oranında atıksu the rheological properties of activated sludge. In this ile işletilen bMBR’lerde membran kirlenmesinde project, the effect of the EPS and SMP concentration birincil bileşen olan EPS ve SMP konsantrasyonlarının which are the primary components for membrane aktif çamur reolojisi üzerindeki etkileri ve membran fouling, at different sludge ages and at 3 different kirlenmesine etkileri araştırılmıştır. C/N ratios on the activated sludge rheology in a submerged MBR were investigated. BIOREACTOR MEMBRANE FILTRATION Wastewater Aeration Bioreactor Aeration Membrane System Treated water (reuse) 27 Excess sludge

15 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ DR. ÖĞR. ÜYESI / ASST. PROF. DR. SAKİP ÖNDER PRINCIPAL INVESTIGATOR BIYOMEDIKAL MÜHENDISLIĞI / BIOMEDICAL ENGINEERING BÖLÜM DEPARTMENT 01.05.2018 - 01.08.2020 BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI TUBITAK 3501 START-END DATE 383.434,8 TL DESTEK TÜRÜ FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET OSTEOENTEGRASYON VE ANTI MIKROBIYAL ÖZELLIKLERINI GELIŞTIRMEK ÜZERE TITANYUM YÜZEYLERIN DEĞIŞTIRILMESI MODIFICATION OF TITANIUM SURFACES TO IMPROVE OSTEOINTEGRATION AND ANTI-MICROBIAL PROPERTIES www.yildiz.edu.tr Kazalar ve hastalıklar sonucu ortaya Titanium (Ti) based implants have been çıkan sert doku kayıplarının giderilmesi used to treat hard tissue disabilities için titanyum (Ti) esaslı implantlar because of accidents and illnesses. sıkça kullanılmaktadır. Fakat çoğu However, revision surgery may be zaman revizyon cerrahisine ihtiyaç often needed following the surgery due duyulmaktadır. Bunun en temel sebepleri to weak attachment to surrounding arasında implantın çevre dokulara tissues, and infections. In this project, zayıf bağlanması ve enfeksiyonlar a functional coating was proposed for gösterilmektedir. Sunulan projede Ti Ti materials to gain them antimicrobial malzemelere hem antimikrobiyal aktivite activity, and to form strong bonds with kazandıracak hem de mevcut dokularla surrounding tissues. daha hızlı ve sağlam bağlanmalarını For this purpose; a functional coating sağlayacak bir kaplama geliştirilmesi için based on drug loaded microspheres çalışıldı. and nanohydroxyapatite (nHA) was Bu amaçla ilaç yüklü mikro küre ve designed. Chitosan based drug nanohidroksiapatit (nHA) esaslı bir (antibiotic) loaded microspheres were kaplama tasarlandı. İlk olarak kitosan esaslı prepared. Two different procedures were ilaç (antibiyotik) yüklü mikro kürelerüretildi. then used to immobilize microspheres Hazırlanan küreleri Ti yüzeylere tutuklamak onto the Ti surfaces: attachment with

15 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Dr. Öğr. Üyesi / Asst. Prof. Dr. Sakip ÖNDER - TUBITAK 3501 için Ca2+ kullanımı ve hapsetme yöntemleri kullanıldı. Ca2+ and entrapment. The microspheres attached Ca2+ yönteminde kürelerin yüzeylere bağlanmasının to the surfaces weakly with Ca2+ while entrapment zayıf olduğu, kitosan ince film içerisinde hapsedilmesi in a chitosan thin film caused strong bonding. nHA durumunda ise Ti yüzeylere çok daha sağlam bir was precipitated following the immobilization. The şekilde yüzeye bağlanabilecekleri gösterildi. Kürelerin performance of the coated Ti surfaces was evaluated tutuklanmasından sonra yüzeylere nHA çöktürüldü. using antimicrobial activity and bioactivity tests. Kaplanmış Ti yüzeylerin performansları antimikrobiyal Antimicrobial tests using S.aureus showed that aktivite ve biyoaktivite testleri ile ortaya kondu. S.aureus antimicrobial activity of the coated Ti surfaces was ile yapılan antimikrobiyal aktivite testleri kaplanmış Ti significantly higher compared to uncoated ones. yüzeylerinin antimikrobiyal aktivitesinin kaplanmamış Bioactivity tests carried out in simulated body fluids yüzeylerden istatiksel olarak daha yüksek olduğunu (SBF) revealed enhanced crystalline HA growth on gösterdi. Yapay vücut sıvısı ile gerçekleştirilen coated surfaces. Therefore, the proposed coating biyoaktivite testlerinde ise kaplanmış Ti yüzeylerinde can be used to improve antimicrobial activity and kristalin HA büyümesinin kaplanmamış yüzeylere bioactivity of the Ti materials. göre daha hızlı olduğu görüldü. Dolayısıyla tasarlanan kaplama Ti malzemelerin hem antimikrobiyal 29 Şekil 1. Kitosan sünger ve serbest mikro kürenin sırasıyla Şekil 3. Yapay vücut sıvısı ile 3 hafta muamele edilen nHA ile kaplanmadan (a,c) ve kaplandıktan sonraki (b,d) nHA kaplanmış (a,b) ve kaplanmamış (a',b') yüzeylerde SEM görüntüleri hidroksiapatit büyümesi Figure 1. SEM images of chitosan sponge and free Figure 3. Hydroxyapatite growth on nHA coated (a, b) microsphere after (a, c) and (b, d) coated with nHA, and uncoated (a ', b') surfaces treated with artificial body respectively fluid for 3 weeks. Şekil 2. nHA ve mikro küre ile kaplanmış Ti yüzeylerin Şekil 4. Kaplanmış Ti malzemelere ait antimikrobiyal aktivite test görüntüleri sonuçları Figure 2. Images of Ti surfaces coated with nHA and Figure 4. Antimirobial activity test results of coated Ti materials microsphere

16 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR BÖLÜM PROF. DR. TARIK EREN DEPARTMENT KİMYA / CHEMISTRY BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI START-END DATE 15.06.2016 - 15.12.2018 DESTEK TÜRÜ TUBITAK 1001 FUNDED BY 374.243 TL BÜTÇESI BUDGET VANKOMISIN ILE ANTIBAKTERIYEL POLIMERLERIN KONJUGASYONU ILE SINERJISTIK ANTIBAKTERIYEL ETKINLIĞININ İNCELENMESI CONJUGATION OF VANCOMYCIN AND ANTIBACTERIAL POLYMERS TO INVESTIGATE THE SYNERGISTIC ANTIBACTERIAL ACTIVITY www.yildiz.edu.tr Enfeksiyona yakalanma riski günümüzde Infectious diseases are critically önemli bir sağlık problemi oluşturmaktadır. important in global healthcare. For Dünyadaki genel durum WHO verileri example, two million nosocomial ışığında incelenecek olursa, 2012- infections occur in hospitals in the United 2014 yılları arasında özellikle bakteriyel States annually and add 5 billion dollars enfeksiyonlardan dolayı gelişmekte olan to healthcare costs. The rate of bacterial ülkelerin yanında diğerülkelerde de ölümle resistance, to even most powerful sonuçlanan vakaların arttığı kaydedilmiştir. antibiotics, is increasing at an alarming Özellikle bakterilerin antibiyotiklere karşı rate. Hospitals are the main source and direnç kazanması bu ilaçların etkisini origin of multiple drug resistant bacteria göstermesini önlemektedir. Bu kapsamda and patients infected with these have yeni ilaçlara ihtiyaç duyulmaktadır. Proje clinical courses and they require çalışmalarında potansiyel antibiyotik prolonged hospital treatments. Based adayı moleküller sentezlenmiştir. on WHO databases, between 2012 and Vankomisin Gram-pozitif bakterilere 2014, deaths due to bacterial infections karşı bakterisit etkisinden dolayı FDA are on the rise not only for developing tarafından onay almış bir antibiyotik countries but also others. Only in the olmasına rağmen Gram-negatif bakteriler United States, almost two million people üzerine etkisizdir. Bu dezavantajı ise bazı get infected second degree and more

16 YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY Biyoteknoloji Biotechnology Prof. Dr. Tarık EREN - TUBITAK 1001 enfeksiyonel hastalıklarda tamamen etkisiz olmasına than five billion dollars are spent only on the R&D ve kullanım alanının sınırlanmasına yol açmıştır. Proje for these types of diseases. In our country as people kapsamında yüksek biyosidal aktivite gösteren iyi dying of infectious diseases are on the rise, Ministary tasarlanmış katyonik polimerler ile vankomisinin ortak of Health declaration against infection based kullanılması ile antibakteriyel özelliği kapsamında diseases, it is emphasized that R&D funding should sinerjistik etki incelenmiştir. Ayrıca çevresel faktörlere be increased for the development of antibacterial karşı son derece labil olan vankomisinin stabilitesini ve and antiviral medicine. Especially in new generation Gram-negatif bakterilere etkinliğini artırmak için proje antibiotic studies, natural and synthetic peptides çalışmaları planlanmıştır. are now frequently encountered. In the synthesis of synthetic derivatives, there are some desired features such as having a wide spectrum, to be 31 resistant towards environmental conditions, low cost, low toxicity with specifity. Vancomycin is widely used antibiotic all around the world. FDA approved Vancomycin, being a bacteriacide effective against Gram-positive bacteria, is nevertheless completely ineffective against Gram-negative bacteria. This disadvantage makes it ineffective in many infectious diseases and limits its use. In order to make vancomycin that is already effective against Gram- positive bacteria, to be effective also against Gram- negative bacteria, a conjugate of vancomycin with an antibacterial cationic polymer is designed. The amphiphilic structure of synthetic polymers disrupts cell membranes, causing breakdown of the transmembrane potential, leakage of cytoplasmic contents, and ultimately cell death. When the mechanism of cell death is investigated, apart from the hydrophobic interactions, the interaction between the positively charged polymer and negatively charged bacteria cell wall also results in cell death. Therefore, in the literature, hydrophobic antibacterial polymers with cationic groups such as pyridine, and primary amine salts are frequently encountered. In this project, highly active, well- designed cationic polymers are planned to be used in conjugation with vancomycine, exploiting the synergistic effects on antibacterial activity. In the synthesis of cationic polymers, controlled polymerization technique ROMP (ring opening methathesis polymerization) method will be used to obtain well defined polymers with precise molecular weights and low polydispersities. In the second stage, vancomycine will be conjugated to the main polymer chain covaletly.

17 PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ YILDIZ TECHNICAL UNIVERSITY PRINCIPAL INVESTIGATOR BÖLÜM DOÇ. DR. /ASSOC. PROF. DR. ÖMER TAHIR GÜNKARA DEPARTMENT KİMYA / CHEMISTRY BAŞLAMA-BITIŞ TARIHI 01.11.2017 - 01.11.2019 START-END DATE TUBITAK 1001 DESTEK TÜRÜ 373.018 TL FUNDED BY BÜTÇESI BUDGET ANTI-KANSER AJANLARI YA DA GSK-3S İNHIBITÖRLERI OLABILECEK HETEROHALKALI YENI MOLEKÜLLERIN SENTEZI VE AKTIVITE ÇALIŞMALARI SYNTHESIS AND ACTIVITY STUDIES OF NEW HETEROCYCLIC MOLECULES WHICH CAN BE ANTI- CANCER AGENTS OR GSK-3S INHIBITORS www.yildiz.edu.tr Son yıllarda, çok çeşitli heterohalkalı In recent years, a wide variety of bileşikler sentezlenmekte ve bunların heterocyclic compounds is synthesized biyolojik aktiviteleri araştırılmaktadır. and investigated for their biological Özellikle heterohalkalı bileşiklerin activity. Heterocyclic compounds, kanser hücrelerine karsı davranışları especially against the behavior of the incelenmektedir. İlaç hammaddesi olarak cancer cells are studied. Since they kullanılabilmeleri nedeniyle piperidin, can be used as pharmaceutical raw piridin, piperazin, oksazol, tiyazolidin ve materials five- and six-membered pirol gibi beş ve altı üyeli heterohalkalı heterocyclic compounds such as bileşikler 20.yüzyılın baslarından itibaren piperazine, pyrrole, pyridine and farmasötik kimyacılar tarafından üzerinde piperidine, at the beginning of the 20th önemle durulan bir konu haline gelmiştir. century by pharmaceutical chemists Bu tür heterohalkalı bileşiklerin yüzyıllık has become a matter which should be tarihinin incelenmesi sonucunda azot ve emphasized. Century of history of such oksijen içeren yapı iskeletinin biyolojik heterocyclic compounds of nitrogen olarak aktif bileşiklerin modellenmesinde and oxygen as a result of examination